【摘 要】
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蛋白质结构相互连接相互作用的性质,对蛋白质结构的同源模建产生较大困难,本文提出一种基于图论的最大团算法来克服这个困难.用氨基酸序列中残基的构象代表图中一个点,根
【机 构】
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华中科技大学自动控制与系统工程学院,武汉,430074
【出 处】
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中国自动化学会系统仿真专业委员会中国系统仿真学会仿真计算机与软件专业委员会2004学术年会
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蛋白质结构相互连接相互作用的性质,对蛋白质结构的同源模建产生较大困难,本文提出一种基于图论的最大团算法来克服这个困难.用氨基酸序列中残基的构象代表图中一个点,根据蛋白质结构中侧链原子与主链原子间的相互作用给每个点赋权,图中每条边连着一对残基,边的权值由两顶点间相互作用决定,由此构建了一个完全图.这样本文提出基于图论的最大团算法,寻找具有最优值的团,它们代表了残基之间的最佳匹配,这种算法可用在同源蛋白质结构的预测中.
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