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甲状腺癌是人类最常见的内分泌恶性肿瘤，约占全身恶性肿瘤的1％，多发病灶是甲状腺癌，尤其是甲状腺乳头状癌的常见特征。本文为了解肿瘤的克隆起源对于研究肿瘤的发生、发展机制的意义，为临床选择合适的治疗方式以及判定疾病预后。本文对组织形态学分析以及微卫星分析((X染色体失活、杂合性缺失)、基因改变分析(BRAE基因突变、RET/PTC基因重排)等分子生物学技术的优缺点进行综述，用于研究甲状腺乳头状癌的克隆起源。