软枣猕猴桃EST-SSR的开发与初步应用研究

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应用SSR Hunter软件对中华猕猴桃EST数据库进行搜索,查找微卫星(Microsatellite)序列。利用检索出的SSR-EST序列设计并合成了150对EST-SSR引物。利用这些引物及已发表的20对中华猕猴桃EST-SSR引物分别在中华猕猴桃、软枣猕猴桃各两个野生居群的基因组DNA中进行PCR扩增,其中有98、103、94和80对引物分别在平江中华猕猴桃、毛坝美味猕猴桃、东北居群的软枣猕猴桃和四川居群的软枣猕猴桃中有扩增产物,可扩增率分别为57.6%、60.6%、55.3%和47%。80对引物在平江中华猕猴桃中扩增出多态,占所用引物数的47%;71对引物在毛坝美味猕猴桃中扩增出多态,占所用引物数的41.8%;60对引物在东北居群的软枣猕猴桃中扩增出多态,占所用引物数的35.3%;47对引物在四川居群的软枣猕猴桃中扩增出多态,占所用引物数的27.7%。这些结果表明,中华猕猴桃EST-SSR在软枣猕猴桃中只具有一定的通用性,而不同地理位置的同物种居群多态性差异较大。本研究开发了数量较多、质量较好的软枣猕猴桃SSR,将为软枣猕猴桃居群遗传学、分子系统地理学以及分子育种提供有效工具。
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