随着高通量测序技术、高分辨质谱技术以及信息处理技术等的发展与应用,系统生物学(组学)在我们生命科学研究体系中的重要性也日渐突出。在目前各种类型的组学中,核酸组学(主要是基因组学和转录组学)告诉我们可能发生什么(发掘生命现象的底层原因),蛋白质组学告诉我们将要发生什么(发掘生命现象的表层原因),而代谢组学告诉我们正在发生什么(发掘生命现象的分子结果),进一步的,代谢组学还可以反馈调节其它生物分子。在蛋白组和代谢组研究中,不同的质谱扮演着不同的重要角色:高分辨质谱(Q-TOF、Q-Exactive)在定性方面优势明显,适合组学研究初期的全谱扫描分析(比如蛋白组的i TRAQ、TMT、DIA等技术以及非靶向代谢组技术);高灵敏质谱(QQQ、Q-Trap)在定量方面优势明显,适合目标分子定量分析(比如蛋白质组的PRM技术以及靶向代谢组技术)。其中LC-MS在蛋白组和代谢组均有应用,而GC-MS由于其只适合分析分子量较小的极性物质,所以仅在代谢组中有应用。单层组学的结果固然很有意义,但如果我们把不同组学结果进行深入整合,进行多层组学研究,实现从原因和结果两个层面探究生命现象的分子本质。这将使得我们的研究更全面、更可靠。进一步地,组学结果结合经典分子生物学方法深入研究也使得组学研究由面到点,实现聚焦与接地气的转变。