精子发生(spermatogenesis)是一高度特化的细胞复杂分化过程，包括精原细胞发育为精母细胞，精母细胞经过两次减数分裂成为圆形精细胞，以及圆形精细胞经过细胞变态形成精子。该过程以减数分裂、染色质重建与包装、转录重组等生殖细胞特异性事件为特征，表观遗传修饰在减数分裂重组、联会复合物的形成、姊妹染色体的结合、减数分裂后精子的变态、基因表达阻遏和异染色质形成过程中发挥着重要作用。其中DNA二核苷酸CpG甲基化变化与基因转录激活、染色质改构以及遗传印记相关，并且认为该甲基化与基因表达之间的关系是非直接的，其可通过染色质结构的改变和/或DNA与蛋白质的相互作用来介导。本文着重介绍精子发生过程中DNA甲基化的转变及其跨代遗传风险、DNA甲基化转移酶的调控机制以及DNA甲基化与男性不育之间的关系等，为不育疾病的防治、精子表观遗传质量评价以及降低辅助生殖技术后代表观遗传疾病风险等提供基础资料。