在国内医药行业快速发展的大背景下，医药企业员工绩效管理的相关问题日益突出。SY集团作为一家由国企改制转型为股份制企业的传统医药企业，如何打破传统管理模式，建立一套针对医药企业员工、符合医药企业实际情况、科学有效的员工绩效管理体系显得至关重要。　　本文以SY集团为例，通过寻找医药企业传统绩效管理引发的问题，从绩效管理手段、管理现状、管理机制和考核指标四个角度出发对其员工绩效管理现状进行分析，研究其引入平衡计分卡的必要性，在此基础上，本文以平衡计分卡为指标体系，从财务、客户、内部运营、学习成长四个方面构建符合SY集团实际情况的平衡计分卡绩效评价指标体系，构建因素集和评语集，以AHM法分析指标权重，以专家打分法评级绩效体系，完成对SY集团员工绩效管理体系的构建。　　医药企业若想建立科学、完整的员工绩效管理体系，需要依据成熟、系统的理论系统，并在实践中不断探索。本文希望通过对SY集团员工绩效管理体系构建地深入研究，应用平衡计分卡绩效管理综合评价策略，寻求一条适应企业自身发展且具有一定普遍性的员工绩效管理模式，从而为我国医药企业员工管理水平的提升和企业自身的健康、可持续发展提供一些可借鉴的思路。