目前，在软件产业中，软件二次开发现象正随着软件技术的发展和软件市场的不断扩大而日益增多。软件的二次开发是指软件的最终使用者根据自己的使用要求，对市场上已存的计算机其有关文档进行的再开发设计活动。 由于软件的设计者在设计软件程序和功能的时候，所针对的对象是社会上的通常情况，并没有根据各个不同的最终使用者来加以设计，因而各个软件的实际使用者在使用软件时会根据自己的使用要求和市场需求预测，对软件加以再开发。 这种二次开发一般分为三种情况： 第一种情况是程序所表现的业务流程、反映的管理理念本身就有问题，或者是不符合国际、国内企业标准的要求，而进行的重新开发； 第二种情况：原有软件所设计的流程不能满足客户特殊的要求或未完成预设软件的开发，这种现实和目的的差异就只好要求修改式的二次开发； 第三种情况是开发人员根据市场需求，对工具软件做出的针对性的二次开发。 在软件二次开发过程中，源程序的提供商和二次开发人员对于软件的结构、程序设计编码、已有数据库数据进行开发利用的时候，由于现代软件所开发具有的交互式数据互访的特性，会随着软件二次开发进程的展开，而涉及到软件的知识产权中的著作权、专利权和商业秘密等部分。 在二次开发过程中，无论是提供商还是开发人员，出于维护自身权益的需要，都必须对这些知识产权的加以维护，并对软件二次开发过程中的侵犯知识产权行为承担相应的责任。能否真正保护软件二次开发过程中的知识产权，这对于二次开发能否成功具有极其重要的意义。 并且，加强软件二次开发知识产权保护适应了软件产业的发展要求，有利于保护我国软件产业发展，促进与其他国家的软件交流。 本文通过以下四部分内容来分析软件二次开发的识权保护： 第一部分：绪论。本章笔者叙述本文的研究方法、动机、研究范围、特色与创新，为随后的论述打下基础。 第二部分：软件二次开发知识产权保护概述。本部分主要对软件二次开发的相关知识、知识产权保护现状、软件二次开发知识保护特殊性意义进行了论述。 第三部分：软件二次开发模式分析。本部分介绍了软件二次开发版权保护模式、专利法保护模式、商业秘密保护模式等，并分析了各保护模式的优缺点。 第四部分：我国软件二次开发知识产权保护的完善。 本部分分析我国目前软件二次开发知识产权保护现状，存在的问题，设计了我国软件二次开发知识产权保护原则，在该原则的指导下提出了软件二次开发保护的模式，并对其中的重点问题进行了研究。