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本实验采用0、100、200、400μM四个浓度的5-氮杂胞苷（5-azaC）溶液分别对菊花品种“泉乡冲天”室外苗进行在体处理。观察记录叶片形状、植株高度和开花时间，测定生理指标叶绿素和丙二醛的含量。应用甲基化敏感扩增多态性（MSAP）和高效液相色谱（HPLC）检测各样本基因组DNA甲基化比例及模式。分析菊花表型变化与基因组DNA甲基化变化的关系。利用cDNA扩增片段长度多态性（cDNA-AFLP）进行基因差异表达分析，从而尝试揭示DNA甲基化对于菊花生长发育及基因表达的作用机制。实验结果如下：（1）表型：5-azaC处理30天后，和对照相比叶片发生卷曲。除此之外，菊花植株发生矮化，四组材料之间株高均有显著性差异，而且有剂量累加效应。去处理20天后，100μM处理组株高恢复和对照相近，200、400μM处理组恢复较慢，依然和对照有显著差异。开花时间和5-azaC的浓度相关，但不是规律性的正相关或负相关。四种浓度处理组的开花时间均有差异，和对照相比，100μM和200μM处理组花期分别提前9天和16天左右，并且，待三组菊花完全开放时，观察花型没有差异，说明5-azaC的处理没有影响其观赏价值。400μM处理组花期推迟3天左右。这表明高浓度的5-azaC有抑制作用。（2）生理指标检测：表型的变化和生理反应密切相关，所以本实验对相关的生理指标进行了检测。各样本叶绿素含量：100μM、200μM叶绿素含量稍高于对照组，400μM含量最少。丙二醛含量：400μM处理组丙二醛含量最高、其它三组相当。由此看来，低浓度的5-azaC对菊花的生理反应影响不大，高浓度的5-azaC对细胞有一定的伤害。（3）甲基化水平检测：以浓度为100、200、400μM的甲基化抑制剂5-azaC处理和未处理的菊花叶片基因组为材料，利用MSAP和HPLC技术对基因组DNA甲基化变化进行分析。结果发现，和对照组相比，各处理组甲基化水平均有所降低，并且随着5-azaC浓度的增加，甲基化降低的幅度也增加，而降低的趋势趋于平缓。（4）基因差异表达分析：以浓度为100、200、400μM的甲基化抑制剂5-azaC处理和未处理的菊花叶片总RNA为材料，利用cDNA-AFLP技术进行基因差异表达分析。结果显示，24对引物组合扩增出772条转录衍生片段（TDF），各处理组与对照相比均有差异表达条带，其中100μM处理组上调表达条带25个；200μM处理组上调表带的条带30个；400μM处理组上调表达的条带22个。选取提前开花组100-400bp之间的16条片段进行克隆测序，成功的10条，7条可以在NCBI中找到同源序列，为已知功能的基因，还有3条为未知基因。其功能主要参与信号转导、蛋白质代谢和抗病。