股权结构是公司治理机制的基础,而治理效率的高低最终体现在公司的经营绩效上,股权结构、治理机制与经营绩效三者之间存在着密切的关系。随着人们生活水平的提高以及医疗体制改革的推进,我国医药类上市公司发展迅猛,已经成为国民经济的重要组成部分。医药类上市公司能否健康成长不仅是证券市场的一个重要问题,也事关整个国民经济的良性发展。因此探明我国医药类上市公司股权结构与经营绩效之间的关系具有重要的理论意义和实际意义。本文以沪深交易所99家医药类上市公司为研究样本,选取这些公司2005至2008年的相关数据,构建了一个“加性”DEA模型来评价医药类上市公司的经营绩效,把相对经营绩效分数作为上市公司经营绩效的衡量指标,利用面板数据对我国医药类上市公司股权结构与经营绩效之间的关系进行实证分析。主要结论如下:第一,我国医药类上市公司国有股比例与经营绩效之间不存在稳定的相关关系;第二,该行业法人股比例同公司经营绩效之间存在着显著的U型关系;第三,该行业流通股比例与上市公司经营绩效不存在显著的相关关系;第四,该行业股权集中度与经营绩效之间存在显著的正向关系。为此提出四点建议:第一,合理控制国有股比例;第二,提升中小股东对公司的监督程度;第三,公司股权适度集中;第四,加强医药类行业收购兼并力度。