中华雏蝗(Chorthippus chinensis Tarbinsky)隶属直翅目(Orthoptera)网翅蝗科(Areypteridae)雏蝗属(Chorthippus)黑翅亚属(Megaulacobolhrus)。目前对雏蝗属的研究多基于外部形态学分析及多种分子标记,但对其种类鉴定及亚属间的分类仍存有很多争议。伴随着高通量技术的日益成熟,在收集、整合和数据挖掘的基础上全方位地研究基因组、转录组和1miRNA已经成为可能。本研究利用Hiseq2000测序平台,对中华雏蝗雌性成虫及雄性成虫两个样本进行了转录组和小RNA深度测序,利用生物信息学方法,对转录组进行功能注释和差异表达基因筛选,并对差异表达基因进行GO功能分析和KEGG代谢通路分析,以深入了解差异表达基因参与的主要生物学功能和代谢途径；此外,对小RNA进行分类注释、已知miRNA比对、已知miRNA差异表达分析、靶基因预测分析和新miRNA预测等多种分析。在转录组水平和niRNA水平对中华雏蝗进行全面研究,得到以下结果：1.中华雏蝗雌雄成虫两个样本转录组测序组装获得总Unigene47,275个,总长45,566,140nt,平均长度964nt,N50达到1,763nt,其中雌性样本获得56,447个Unigene,总长度39,236,142nt,平均长度695nt,N50为1,455；雄性样本得到50,222个Unigene,总长度35,926,168nt,平均长度为715nt,N50为1,459。对两个样本分别得到的Unigene进行聚类拼接和去冗余处理,得到中华雏蝗All-Unigene共计47,275条。2.对得到的Unigene进行功能注释,注释到NR, NT, Swiss-Prot, KEGG, COG和GO库的All-Unigene分别是20,784个,10,822个,17,257个,15,183个,8,516个和10,544个,所有注释上的Unigene是22,544个,占到了总数(47,275个)的47.69%。NR物种分布结果表明,转录组数据比对到赤拟谷盗的序列最多,占到了13.84%。3.对两个样本进行差异表达分析,最终得到13,390个差异表达基因(DEGs) (FDR