猫E3复合体在原核系统中的表达与纯化

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自FIV发现以来备受科学家的关注。从基因组,病毒生命周期以及感染后的发病症状多方面分析FIV与HIV-1都有很多相似之处,FIV可作为一个动物模型以推动HIV-1药物的研究。研究发现,FIV Vif在FIV病毒中的作用类似HIV-1Vif,能够与猫Cullin5-ElonginB-ElonginC复合物相互作用形成E3复合体介导猫A3蛋白的降解。本文目的是通过体外原核共表达FIV Vif-ElonginB-ElonginC E3复合蛋白提高FIV Vif的可溶性并获得高纯度蛋白进行结晶获得FVif蛋白的晶体结构,以期对HIV-1Vif抑制剂的设计具有一定的指导意义。本研究以pST39为原核表达载体,在FIV Vif单独表达式,蛋白表现出很低的溶解性,因此很难通过层析方法获得大量的可溶性蛋白。为了提高FIV Vif的溶解度,借鉴HIV-1Vif的研究经验采用原核系统共同表达FIV Vif,ElonginB和ElonginC的方式,使这三种蛋白共同作用形成E3蛋白复合体。结果显示通过三种蛋白的相互作用整个蛋白复合体的溶解性大大提高,但是后续的纯化结果显示蛋白纯度很低,可能是FIV Vif较长的N端很难以稳定存在才导致了蛋白的错误折叠。为了获得高纯纯度的FIV Vif/EB/EC E3复合蛋白,使用Discovery studio和VectorNTI对FIV Vif的蛋白序列进行分析,最终针对FIV Vif设计了FVifdN24, FVifdN58, FVifdN115, FVifdN149, FVifdN183,FVIFdN8/dC241FVIFdN8/dC226,FVIFdN30/dC241, FVIFdN60/dC241等11个截短体。其中dN58, dN30/dC226,dN60/dN226克隆构建失败,dN8/dC226,N60/dC241截短体蛋白没能成功诱导表达。其余7种截短体复合蛋白在验证表达以后通过AKTA蛋白纯化系统进行纯化。纯化结果显示,在所有蛋白复合体中,FVifdN24具有较好的纯化效果,最终经过分子筛纯化后蛋白纯度达到80%;FVifdN149具有非常好的纯化效果,单单经过Ni柱纯化后就有80%的纯度,经过进一步的Resource Q以及Superdex-200纯化蛋白纯度高于90%。经过大量纯化获得了足量的高纯度的两种蛋白复合体,并送至合作单位进行蛋白结晶。结晶结果显示两种蛋白都没有获得好的晶体,其中被寄予厚望的dN149蛋白复合体出现小晶体,但不能用于X射线衍射分析。研究表明,CBF-β参与了HIV-1Vif介导的E3复合体的形成,并起着不可或缺的作用。为了验证在FIV Vif介导形成的E3复合体中猫的CBF-β是否也是不可缺少的一部分,本文分别在原核体系与真核体系中验证了两种蛋白的相互作用。真核体系中,通过体外共转FIV Vif-HA与猫CBF-β-Flag,使用免疫沉淀的方法验证了在真核细胞中两种蛋白的相互作用。免疫沉淀结果显示FIV Vif与猫CBF-β在细胞中没有直接的相互作用。原核系统中将CBF-β于FIV Vif,ElonginB,ElonginC四种基因嵌入pST39中进行共表达,然后进行Ni柱亲和层析,通过分析Ni纯化的蛋白组分的方式来验证二者之间的相互作用。结果显示,在原核体系中CBF-β并不能与FIV Vif,ElonginB,ElonginC共同形成稳定的蛋白复合体,说明在FIV Vif介导的E3复合体中猫CBF-β可能并非必不可少的。综合真核和原核系统的实验结果得出结论:猫CBF-β并不是猫E3复合体中的必需组分。
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