穆勒的求因思想，集中体现在A System of Logic, Ratiocinative and Inductive（《逻辑体系：演绎和归纳》）中，自1843年该书问世后，在他生前出版过8次，被誉为“影响到全世界”。进入20世纪以来，人们在反思政治实践、市场经济带来的一系列道德后果时，开始关注苏格兰启蒙思想，进而引发对穆勒关于探求现象间因果关系的方法论的研究热情。从科学方法论的意义上讲，穆勒求因方法为科学归纳方法的有效性提供了依据；从人文价值方面看，穆勒求因思想同时承载着对人类社会发展的时代关切。关于归纳方法最早可追溯到古希腊时代，到了穆勒那里，他试图为更加完备的科学归纳法制定规则，使得科学归纳法知其然并知其所以然，即为科学归纳提供了探求因果关系的方法。科学归纳法弥补了简单枚举法的不足，又凸显了简单枚举法的优势，从事物的因果关系中揭示事物的内在关联。虽然其结论仍是或然的，但比起简单枚举法的或然性就大大降低了。穆勒文本中提出了关于契合法、差异法、共变法和剩余法，在实验科学的基础上，为人们探寻自然现象间的因果关系提供了有效方法。同时，他将自然科学方法引向对社会问题的思考之中，试图以此来分析社会现象间的因果关系。他的求因方法具有科学与人文兼容性。在研读其文本的过程中，发现穆勒的求因方法生成于实验科学领域，而却可以运用到政治、经济、社会、历史以及道德领域，拓宽这些领域科学研究方法的发展路径。对于穆勒来说，这是一次尝试，更是一次突破。本文拟从科学和人文的双重维度深层次地挖掘穆勒求因思想的方法论意义，揭示其内蕴的人文关怀。同时，也深入剖析穆勒方法在应用过程中的局限性，为穆勒求因思想摆脱困境留下思考空间。