90例发育迟缓患儿的高通量测序检测及遗传学分析研究

来源 :山西医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lingling850502
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:利用基于高通量测序的低深度全基因组测序技术(Copy Number Variation sequencing,CNV-seq)对90例发育迟缓的患儿进行遗传学检测和分析,以核型分析结果和相应临床表型作为参考,探讨发育障碍疾病的致病性染色体拷贝数变异(CNVs)和临床表型的相关性,筛选可能致病的候选基因,寻找相对高频的致病性CNVs,明确致病原因。对部分CNV-seq检测结果阴性的患儿进行全外显子组测序(Whole Exome Sequencing,WES),寻找可能的致病位点。探讨发育迟缓患儿的相关遗传学机制,为父母再生育及遗传咨询提供理论指导。方法:收集从2017年到2019年在山西省儿童医院(山西省妇幼保健院)诊断为发育迟缓、并已做过核型分析的患儿的临床资料(包括基本信息,临床表型,遗传学资料等);收集患者外周血进行CNV-seq检测,并对其检测结果进行致病性分析;利用Clin Var、DECIPHER、OMIM、DGV等数据库对CNV-seq检测结果进行注释,依据ACMG评估CNVs的致病性,并通过Pub Med数据库检索相关的报导文献;对部分CNV-seq检测结果阴性的患儿进行全外显子组测序(WES),通过国家人类遗传资源共享服务平台,对结果进行生信分析,结合临床表型,明确患儿变异基因的致病性。结果:检测90例发育迟缓患儿,致病性CNV检出相对高频的是7、8和22号染色体,检测出致病性或可能致病性CNVs 18例,CNV-seq阳性检出率为20%(18/90)。其中ACMG判定致病性,有报导致病性CNVs案例的15例,可能致病CNVs案例3例。CNV-seq阴性结果共72例,其中临床意义未明的CNVs变异(VOUS)有32例,结果正常的CNVs有35例,多态性CNVs有5例。核型分析明确提示发育障碍疾病患者4例,可能与疾病相关者1例,通过CNV-seq全部得以确认。对其中10例CNV-seq检测结果阴性的患儿进行全外显子组测序(whole exome sequencing,WES)检查后,在基因组拷贝数变异(CNVs)结果正常的患儿中,检测到一例KMT2A基因新发无义变异导致的Wiedemann-Steiner综合征。结论:本研究证实了CNVs是导致儿童发育迟缓的重要病因,以及大于1Mb的微缺失/微重复具有更高致病性的特征。致病性CNV检出相对高频的是7、8和22号染色体,且检出的微缺失/重复片段大多已知与发育迟缓疾病密切相关,并筛选出可能致病的候选基因。CNV-seq是诊断该类疾病的一线检测方法,与传统核型分析相比,CNV-seq是一种基于高通量测序的、更高效的基因检测技术,能检测大多数染色体微缺失/微重复所致疾病,并解释相关临床表型。与全外显子组测序(WES)联合应用,对CNV-seq结果阴性患儿检测,能及时发现部分发育障碍相关疾病及其可能致病的基因位点。建立不同基因组CNVs、基因变异与患者表型之间的相关性,能为疾病诊断及再次生育提供遗传学依据。
其他文献
目的:分析妊娠合并癫痫患者在妊娠期间癫痫发作频率变化、抗癫痫药物的使用及妊娠结局、分娩方式以及新生儿喂养方式等,为癫痫女性的妊娠期及哺乳期管理提供科学依据。方法:收集2013年4月至2018年11月在山西医科大学第一医院住院的妊娠合并癫痫患者,根据纳入及排除标准共纳入61例患者,分析其年龄、孕周分布、口服抗癫痫药物的种类与胎儿畸形的关系、近年来癫痫发作频率变化、抗癫痫药物使用率的变化、分娩方式的变
目的:脑静脉窦血栓形成(cerebral venous and sinus thrombosis,CVST)是颅内静脉系统一种相对罕见的临床疾病,尽管发病率低,但由于病因复杂及缺乏特定的临床症状,易出现误诊、漏诊的情况,导致部分未能早期诊断及治疗的患者预后较差,死亡率高。近年来,影像学技术尤其是磁共振成像(magnetic resonance imaging,MRI)的广泛应用使CVST的确诊率有
目的:观察帕金森病(PD)患者黄斑区视网膜厚度及微血管的变化特点,并分析神经节细胞层(GCL)厚度、血管密度(VD)、灌注密度(PD)及中心凹无血管区(FAZ)与帕金森病病程、Hoehn-Yahr(H-Y)分级及统一帕金森病评定量表第三部分(UPDRS-Ⅲ)评分的相关性。方法:收集2020年9月至2021年1月由山西医科大学第一医院神经内科确诊的PD患者20例(40只眼)作为帕金森病组,以及与之年
目的:探讨超声引导下关节腔联合肩周注射治疗偏瘫肩痛的临床疗效。方法:从2017年10月至2020年8月我院康复医学科住院病例中筛选出符合要求的118例偏瘫肩痛患者病例,按注射方案不同分为两组:单纯关节腔注射组(A组,43例)、关节腔联合肩周注射组(B组,75例),其中B组分为3个亚组:关节腔联合肩峰下滑囊注射组(B1组,30例)、关节腔联合肱二头肌长头肌腱鞘注射组(B2组,24例)及关节腔联合喙突
目的:通过动静态平衡仪定量分析后循环缺血性脑卒中患者双下肢的平衡功能,并与健康人对比,为制定临床康复治疗方案提供依据。方法:在2018年12月-2021年3月从山西医科大学第一医院神经内科转入康复医学科、未经我科康复训练、病灶为单侧、病程在2个月内的后循环缺血性脑卒中患者中,按照严格的纳入及排除标准选取20例患者作为病例组。选择与病例组患者年龄、身高、体重相匹配的正常人20例作为对照组。借助意大利
目的:了解太原市孕妇孕期PM2.5暴露特征、孕妇血浆铅水平以及新生儿出生体重状况,分析孕期PM2.5暴露水平对新生儿出生体重的影响,并通过测定孕妇孕期血浆铅浓度探讨孕期PM2.5暴露是否可以通过影响孕期血浆铅浓度进而影响新生儿出生体重的相关作用机制,即血浆铅在孕期PM2.5暴露与新生儿出生体重中的中介作用。为保护孕妇和新生儿健康,进一步明确生命早期PM2.5暴露对新生儿出生体重影响的可能机制以及合
目的:了解太原市孕妇每日来源于不同种类食物的铜元素摄入量及铜元素摄入总量,检测孕妇血浆铜水平,探讨铜元素摄入量与孕妇血浆铜水平的关系;探讨孕期膳食铜元素摄入水平及各类富铜食物对新生儿出生结局的影响,为根据地域膳食特点,指导孕妇合理膳食,减少铜摄入不足对新生儿出生结局的影响提供新的理论依据。方法:采用方便抽样的方法,在2018年8月至2020年1月期间,选取某医院396对母婴对纳入研究。以面对面填写
目的:探讨ABCD2评分、胱抑素C以及ABCD2评分联合胱抑素C对短暂性脑缺血发作患者早期脑梗死风险的预测价值。方法:选取我院神经内科2019年10月至2020年12月临床上收治为TIA的住院患者,入院后24小时内完善各项常规血清标本及血清胱抑素C的检验,并对最近一次的TIA发作采用ABCD2评分进行评估,行头颅MRI检查;所有患者根据2014年短暂性脑缺血发作诊治指南均予以阿司匹林、氯吡格雷联合
目的:1.探究脑小血管病患者不同严重程度的CSVD总体负担与其步态改变的关系;2.探究施加认知任务干扰下的步态改变与CSVD总体负担的关系。方法:选择85例CSVD患者依据总体负担四分法分成轻度组(≦1分)、中度组(2分)、重度组(≧3分),分别行单纯步行任务、认知任务干扰(100-7及动物列名)下步行任务,利用可穿戴设备分析比较各组步态参数,包括步速、步幅、步频、跨步时间、跨步时间变异系数(CV
目的:将益生菌(酪酸梭菌活菌散)作为儿童支气管哮喘的辅助治疗,与标准儿童支气管哮喘治疗方法的临床疗效进行对比,进而评估益生菌应用于儿童支气管哮喘辅助治疗的临床疗效,为临床医师治疗儿童支气管哮喘采取更优的治疗方案提供参考依据。方法:选择2019年07月至2020年07月就诊于山医医科大学第一医院儿科的哮喘发作且符合纳入标准的哮喘患儿106例,随机分为益生菌组和对照组,各组53例。对照组采用标准治疗方