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胆固醇是影响卵母细胞和胚胎发育的重要物质,VLDL是产蛋鸡胆固醇的主要载体,影响着卵母细胞和蛋黄中的胆固醇含量,而HMGCR(3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶,HMG-CoA reducase)是胆固醇合成过程中的限速酶。本试验以眉山温氏400只青脚麻肉种鸡为研究对象,分析血清VLDL浓度及HMGCR基因多态性的关系及其对繁殖性状的影响,结果如下：试验检测了384份血清的VLDL浓度,按浓度大小由低到高分为1-4组(44-200、2002～400、400～600、600～720mg/ml血清),各组对应的产蛋量依次为：90.35、105.70、103.65、93.46。其中,第1组与第2组、第3组与第4组的产蛋量差异极显著(P<0.01),第1组与第4组、第2组与第3组差异不显著(P>0.05)；1、2组血清VLDL浓度与产蛋量呈正相关(r=0.51,P<0.01),3、4组血清VLDL浓度与产蛋量呈负相关(r=-0.41,P<0.01)。而各组的受精蛋孵化率和受精蛋健雏率差异不显著(P>0.05)。表明中等血清VLDL浓度组(VLDL浓度200～600mg/ml血清)的产蛋量较高。试验设计了6对引物,采用PCR-SSCP方法,扩增了HMGCR基因的部分外显子和部分内含子序列,检测到3个多态位点。分别为内含子1处的SNP1(789bp, G/A)和SNP2 (937bp, C/G)、内含子4处的SNP3(2316bp, A/C)。3个位点均为中度多态(PIC值分别为0.3551、0.3204、0.3749)HMGCR基因多态性与繁殖性状的关联分析发现：各位点不同基因型在受精蛋孵化率、受精蛋健雏率性状中的差异不显著(P>0.05)。在产蛋量性状中：SNP2中的C、D型差异不显著(P>0.05); SNP1、SNP3的不同基因型差异极显著(P<0.01),B型比A型高11.95个蛋,E型比F型高4.95个蛋,表明B、E型为高产蛋量的优势基因型。单倍型分析发现,各单倍型在受精蛋孵化率、受精蛋健雏率性状中的差异仍然不显著(P>0.05),在产蛋量性状中的差异极显著(P<0.01),最好单倍型为BCE(106.11),最差单倍型为ACE(84.90),相差21.21枚蛋,大于单个位点变异的差异。HMGCR基因多态性与血清VLDL浓度的关联分析发现：各位点的不同基因型差异极显著(P<0.01)。其中,B_、C_、E_型为低血清VLDL浓度,A_、D_、F_型为高血清VLDL浓度,A_比B_、D-比C_、F_比E_分别高214.07、228.99、73.57(mg/ml血清)。表明3个SNP位点的变异极显著地影响血清VLDL浓度。进行单倍型分析后发现,各单倍型的差异仍然达到了极显著水平(P<0.01),最高单倍型为ADE(502.12),最低单倍型为ACE(184.40),相差317.72(mg/ml血清),大于单个位点变异的差异。关联分析结果表明,单倍型在选择产蛋量、高低血清VLDL浓度方面比单个SNP的效率更高。ACE单倍型的产蛋量和血清VLDL浓度都最低,进一步表明过低的血清VLDL浓度明显降低了产蛋量,所以在肉种鸡的肥度性状中不宜过度追求低胆固醇。转录因子结合位点分析中：SNP1的变异(G→A)造成了一个Oct-1转录因子结合位点的增加,同时也使CdxA转录因子结合位点的分值增加；其他两个SNP没有查到有意义的转录因子结合位点的变化。综上所诉,中等VLDL浓度(200～600mg/ml血清)可作为提高产蛋量的候选指标。HMGCR基因的内含子SNPs可作为提高产蛋量的分子标记,而且单倍型效率比单个SNP更高,以BCE单倍型最佳。对于HMGCR基因多态性、血清VLDL浓度水平和繁殖性状三者的关系仍需进一步研究。