基于MCMC方法的零膨胀计数型性状位点的区间定位

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在生物学世界中,经常观察到一些带有过多零的计数表型.零膨胀计数数据的QTL定位的统计方法已经被广泛研究.然而,已经存在的大部分方法是通过全基因组扫描来发现QTL在染色体上的近似位置,并且使用EM算法进行参数估计.本文针对零膨胀计数型数据提出了QTL的贝叶斯区间定位方法.该方法利用零膨胀广义泊松(简写为ZIGP)回归模型来研究QTL对零膨胀计数表型的影响.本文应用MCMC算法对QTL的效应和位置参数进行估计,同时使用Haldane图谱函数完成重组率和图谱距离的转换.本文采用蒙特卡洛模拟实验来检验所提方法的优点和可应用性,另外还使用了F2小鼠数据集来证明数量性状位点对小鼠胆固醇胆结石形成的影响.
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