为提高昆明市科技计划项目资金绩效水平提供理论支持,使科技投入更具有导向性,从地方层面上调整科技发展战略、优化公共创新资源配置、提高资源利用率,为地方政府的管理者明确科技定位,改进科技管理工作,提供调整创新策略的决策依据和改进的思路,通过建立科技计划项目投入绩效评价指标体系,对地方政府科技计划项目投入绩效进行综合评价,本文首先对昆明市政府科技投入的绩效进行客观评价,利用科技计划项目绩效问卷调查和专家评分的数据,构建科学、合理的地方政府科技投入绩效评价指标。昆明市财政科技项目绩效评估体系按照项目绩效的构成要素进行分解,形成地方科技投入、直接产出、经济效益产出、社会效益产出四个要素绩效评价指标体系。以昆明市2009年和2010年地方政府科技投入产出数据为例,运用层次分析法(AHP)按工业、农业、合作项目分类,对各领域科技计划项目绩效情况进行对比,寻求平衡发展和重点发展的投资方向,最后利用综合测算模型,把多个指标对绩效评价体系不同方面的权重综合,得到一个整体的评价结果,从而对比各年度科技计划项目科技投入绩效评价总体情况。运用模糊(Fuzzy)综合评判法建立模型对昆明市政府科技投入科技成果产出指标,环境污染指标,资源能源指标,产品应用于市场指标,经济效益绩效评价进行研究,对地方政府科技计划项目投入产出绩效进行评价。结合昆明市科技与经济特色,分析评价结果得出昆明市政府科技投入存在的主要问题,并找出问题出现的原因和解决办法。构建昆明市政府科技计划项目投入的绩效评价模型并加以实证,找出影响其绩效水平的原因,并提出相应的对策建议,这是对地方政府科技投入绩效的有益探索,结果显示地方政府科技投入政策对指导科技项目起着决定性作用,对社会经济发展和科技创新有着推动作用,绩效评价方法体系在其他各地方政府科技投入的绩效评价中可借鉴应用。