细菌是水产养殖生态系统的重要组成部分,本文采用培养方法和Miseq高通量测序法对5个不同发育时期的虾夷扇贝(Patinopecten yessoensisis)幼体及其育苗池水体(受精卵时期S1/W1,担轮幼虫S2/W2,D形幼虫时期S3/W3,壳顶幼虫时期S4/W4,稚贝期S5/W5)中的细菌群落组成动态进行了研究。同时对分离得到的细菌进行产酶能力、拮抗病原菌、溶血活性和安全性进行测定以筛选出扇贝育苗用潜在益生菌。经Miseq高通量测序从扇贝幼体及育苗池水体分别获得106760和96619条优化序列。通过16S rRNA基因序列比对,幼体序列归属为4个门,7个纲,15个目,21个科,31个属;育苗池水体序列归属为9个门,17个纲,33个目,50个科,83个属。门水平,变形菌门为首要优势门。属水平,假单胞菌属是S1、S2和S5的首要优势属。S1其余优势属还有发光杆菌属和气单胞菌属,S2的次优势菌属依次为沙雷氏菌属,寡养单胞菌属和不动杆菌属,S5的次优势菌属希瓦氏菌属和假交替单胞菌属。在S3和S4中假交替单胞菌属为首要优势属,S3中的其它优势属依次为发光杆菌属,假单胞菌,Aliivibrio和希瓦氏菌属,S4中的其它优势属依次为假单胞菌属,Aliivibrio,希瓦氏菌属,冷单胞菌属和嗜冷杆菌属。育苗池水体优势门为变形菌门和拟杆菌门。属水平,W1、W4和W5的主要优势属均为假交替单胞菌属和亚硫酸杆菌属,W4的其它优势菌属依次为交替单胞菌属、Phaeobacter和玫瑰杆菌属,W5的其它优势菌属依次为玫瑰杆菌属和交替单胞菌属。而W2的优势菌依次为弧菌属、假交替单胞菌属、亚硫酸杆菌属、玫瑰杆菌属和Aliivibrio。W3的优势菌依次为Glaciecola、玫瑰杆菌属、亚硫酸杆菌属、交替单胞菌属和极地杆菌属。结果表明虾夷扇贝育苗过程中不同发育时期的育苗池水体所含细菌的多样性比幼体的丰富,各发育时期幼体及水体细菌群落结构存在不同程度的差异。采用培养方法从扇贝幼体及育苗池水体中共分离得到300株细菌,通过16S rRNA基因测序分析比对,从幼体得到的150株细菌归属于2个门、3个纲、8个目、12个科、16个属、39个种;从育苗池水体得到的150株细菌归属于2个门,3个纲,6个目,9个科,10个属,22个种。门水平,无论是幼体还是育苗池水体变形菌门均为优势门,其次为厚壁菌门。属水平,弧菌属是S1,S2和S3的首要优势属。假交替单胞菌属是S1,S2和S3的第二优势菌属。S1优势属还包括动性球菌属;S2的其它优势属依次为亚硫酸杆菌属和芽孢杆菌属;S3的其它优势属依次为动性球菌属和交替单胞菌属。假交替单胞菌在S4和S5中为首要优势属,弧菌属在S4和S5中为第二优势属。S4的其它优势属为芽孢杆菌属和交替单胞菌属;S5的其它优势属为芽孢杆菌属和Pontibacillus;育苗池水体中假交替单胞菌属为第一优势属;W1、W2和W3的其余优势属为交替单胞菌属和弧菌属;W4的其它优势菌依次为交替单胞菌属和芽孢杆菌属;W5的其它优势属为弧菌属和Pseudophaeobacter。结果表明扇贝幼体所含的异养细菌种类要比育苗池水体中所含异养细菌种类丰富,各发育时期幼体及水体细菌群落结构存在不同程度差异经过产淀粉酶、蛋白酶、纤维素酶三种产酶能力测定及以灿烂弧菌为指示菌株的拮抗活性测定,从300株细菌中筛选出既能够产酶又拮抗灿烂弧菌的4W25菌株和3S16菌株,经过16S rRNA基因测序分析鉴定,结果显示2株菌分别与Pseudoalteromonas espejiana和Bacillus aerophilus的序列相似性分别为100.0%和99.8%。溶血实验结果表明,4W25菌株不产生溶血素,不具有潜在的致病性。在24孔板中以终浓度为1×106 cells/mL的4W25菌株浸浴感染受精后9 d的扇贝幼体48 h,结果显示,实验组和对照组死亡率无显著差异,表明该菌株对扇贝幼体是安全的。