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昆虫烟碱型乙酰胆碱受体(nicotinic acetylcholine receptor,nAChR)和电压门控钠离子通道(Voltage-gated sodium channel,VGSC)是昆虫神经传导过程中的重要蛋白,分别为新烟碱类和拟除虫菊酯类杀虫剂的作用靶标。鳞翅目是昆虫纲第二大目,其幼虫通常为植食性,其中有许多农业害虫。家蚕为鳞翅目模式生物,研究家蚕nAChR和电压门控钠通道对害虫防治具有重要意义。
nAChR基因家族通常含有十个以上的成员,这些成员的组合形成了nAChR复杂的分子类型,对生理功能的研究造成了很大困难。迄今为止,昆虫nAChR未能通过自己亚基组合在爪蟾卵母细胞内表达,用于电生理学性质的研究和农药筛选。本文对家蚕nAChR进行了以下研究:
通过Blast检索家蚕基因组数据库和RT-PCR、RACE技术,克隆了家蚕12个编码nAChR亚基基因的全长ORF。家蚕nAChR基因与果蝇nAChR基因相似性最高达86%;其中9个亚基亚基为α型,3个亚基为β型;果蝇、冈比亚按蚊、蜜蜂和家蚕的α6亚基具有相同的内含子位置。
亚基α4含有一对相互排斥的外显子3,亚基α8含有一对相互排斥的外显子7。亚基α8相互排斥的外显子编码TM2和TM3,迄今为止仅在家蚕中发现。α4截短的转录本缺少外显子6~8,这些外显子编码LoopF和TM1-3。α5截短的转录本缺少外显子4,导致下游阅读框发生移码和翻译提前终止,只剩下一个很小的开放阅读框,只有α6亚基上发现了五个RNA编辑位点,5个碱基的RNA编辑(nts#392,394,395,447,454)导致了四个氨基酸的变异(N131S,N132G,I149M,T152A)。
使用real-timePCR技术,对七个转录本在不同发育阶段,幼虫不同体段进行了表达量分析。结果表明:所有转录本在头部表达量最高,腹部表达量最低;所有转录本在蛹和成虫阶段的表达量都高于幼虫。在胚胎期,转录本α4exon3、α7、β1的表达量高于幼虫,而转录本α2、α8exon7a、α8exon7b的表达量低于幼虫,转录α4exon3表达量和幼虫相当。在昆虫细胞中高效表达了所有亚基的胞外受体片段,为受体相互作用研究打下了基础。
通过家蚕基因组数据库检索结果和RT-PCR技术,克隆了家蚕钠通道基因的全长ORF,命名为BmNav。BmNavORF全长6,258bp,编码2,085个氨基酸残基,含有34个外显子。BmNav和果蝇、德国小蠊、人钠通道氨基酸序列相似性分别为74%、77%、43%。家蚕钠通道含有24个跨膜螺旋,分属于钠通道的4个结构域,每个结构域含有6个跨膜螺旋。
对胚胎、幼虫、蛹、成虫四个发育时期的BmNavPCR产物进行超通量Solexa测序。测序结果未发现RNA编辑,发现BmNav存在大量可变剪接.外显子丢失除发生于结构域之间的连接肽之外,还发生于膜结构,可选择性外显子2、外显子12和外显子22i编码结构域之间的连接肽,它们的丢失不影响通道的保守结构,不含外显子2的转录本在四个发育时期的含量达到33%~55%,外显子12为家蚕特有。家蚕BmNav存在两对相互排斥的外显子,19a/b和27a/b。Solexa测序发现不含外显子19的转录本在幼虫阶段表达量异常高,常规RT-PCR验证发现,这种高量表达在五龄幼虫第三天达到峰值,随后下降。