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本研究采用双垂直板聚丙烯酰胺凝胶电泳技术，对桃属(Amygdalus persica L．)的5个种及其外类群李共6个分类群的99份材料进行了等位酶遗传多样性检测和种间关系分析，拟为桃种质资源收集、保存和利用以及主要种间关系的研究提供等位酶水平上的理论依据。本研究所用的材料包括桃属的5个种：普通桃(Amygdalus persica L．)、甘肃桃(Amygdalus kansuensis Skeels)、山桃[Amygdalus davidiana(Carr．)Yǖ]、光核桃(Amygdalus mira Koelme)、新疆桃(Amygdalus ferganesis Kov．et Kost．)和外类群李(Prunus salicina L．)。等位酶分析结果表明：1．在供试材料的6个种中，在11个酶系统的24个位点上共检测到69个等位基因，位点最大等位基因数为8。6个种的遗传多样性参数中，每位点平均等位基因数(A)、多态性位点的比率(P)、平均实际杂合度(Ho)和平均预期杂合度(He)分别为：1.76、46.53％、0.282和0.305；其中以普通桃的多态位点比率和每位点平均等位基因数最高，分别为79.2％和3；山桃次之，分别为79.2％和2.3；新疆桃为45.8％和1.5；光核桃为33.3％和1.3；甘肃桃最低，分别为16.7％和1.2。2．对普通桃20个多态性位点，进行观测杂合度与预期杂合度Chi-square检验，其中有15个多态位点在P≤0.01水平下显著，1个多态位点在P≤0.05水平下显著，说明其具有杂合基因型的个体数量多于Hardy-Weinberg期望值。3．新疆桃聚在普通桃种内，与油桃聚在一起，它们间的遗传一致度为0.973。4．运用Biosys-2和TFPGA软件进行种间关系分析，NTSYS2.10软件进行单株UPGMA聚类分析，各种间聚类结果为普通桃与新疆桃最先相聚，然后与山桃聚为一组，待所有的桃属植物聚在一起后，最后是外类群李属植物相聚，11个酶系统的分析数据可将99份试材鉴别分开，并且单株聚类的趋势与种间聚类结果相一致。