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荒漠草地占新疆草地总面积的46.9%。准噶尔荒漠作为我国唯一受北冰洋气流影响的荒漠,与其他荒漠的气候差异显著,且植被和土壤类型也各不相同。本文以准噶尔盆地大面积分布的3种代表性荒漠植物群系（南缘伊犁绢蒿群系、腹地白梭梭群系和北缘盐生假木贼群系）为对象,通过野外样点调查、室内测定分析及高通量测序技术,对3种荒漠植物群系的植被、土壤微生物和草地生产力及碳氮储量进行分析比较;通过与环境因子的耦合分析,明确荒漠植物群系植物、土壤微生物多样性的空间分布特征,解析影响其分布的关键环境因子,探讨荒漠植物/土壤微生物多样性与草地功能之间的关系。研究结果不仅可以增进对准噶尔盆地荒漠植物/土壤微生物群落空间变化规律的认识,还可为深入了解荒漠生态系统结构和功能,建立合理管理措施提供重要依据。主要研究结果如下:（1）土壤有机碳含量大小排序为:伊犁绢蒿群系>盐生假木贼群系>白梭梭群系,土壤全氮含量与土壤有机碳的变化规律一致。禁牧后,3种荒漠植物群系土壤有机碳和全氮含量有一定增降变化,但差异不显著（P>0.05）。土壤有机碳含量与年均降水量（60～160 mm）呈“单峰”变化趋势（二次多项式）,而与年均温（4～10℃）呈线性负相关关系;土壤全氮含量与年均降水量和年均温均呈“单峰”关系。（2）通过对3种荒漠植物群系植物群落的调查,共记录植物6科13属15种,其中伊犁绢蒿群系4科7属7种,白梭梭群系4科6属7种,盐生假木贼群系2科6属6种,物种多样性总体较少,藜科植物在3种荒漠植物群系中占比超过50%。白梭梭群系的群落高度和生物量最高,伊犁绢蒿群系次之,盐生假木贼群系最低;伊犁绢蒿群系群落密度和盖度最高;盐生假木贼群系次之,白梭梭群系最低。禁牧显著增加了3种荒漠植物群系的群落高度、盖度和地上生物量（P<0.05）,但群落密度在不同荒漠植物群系对禁牧的响应不一致。（3）3种荒漠植物群系的Pielou均匀度指数存在显著差异（P<0.05）,伊犁绢蒿群系和盐生假木贼群系的Simpson优势度指数无显著差异（P>0.05）,但二者均显著高于白梭梭群系,伊犁绢蒿群系的Shannon-Wiener指数显著高于白梭梭群系和盐生假木贼群系（P<0.05）。3种荒漠植物群系的Sorenson相似性指数介于0.29～0.31,Jaccard指数介于0.17～0.18,两种指数均较低,表明3种荒漠植物群系群落相似性较弱,共有种较少。禁牧后,伊犁绢蒿群系和盐生假木贼群系的Simpson优势度指数分别显著增加了19.3%和15.8%（P<0.05）,但白梭梭群系的Simpson优势度指数对禁牧的响应不明显（P>0.05）;3种荒漠植物群系的Pielou均匀度指数对禁牧的响应不显著（P>0.05）;伊犁绢蒿群系、白梭梭群系和盐生假木贼群系Shannon-Wiener多样性指数自由放牧区较禁牧区分别显著下降了19.8%、7.7%和21.3%（P<0.05）。Shannon-Wiener多样性指数和Simpson优势度指数与年均降水量、年均温之间均呈“单峰”关系;Pielou均匀度指数与降水量呈线性正相关关系,与年均温呈线性负相关关系。（4）放线菌门、变形菌门、绿弯菌门、酸杆菌门、芽单胞菌门和拟杆菌门是准噶尔荒漠土壤细菌群落的6个主要优势类群;子囊菌、担子菌和未定名真菌是土壤真菌群落的3个主要优势类群。土壤细菌α多样性排序为:伊犁绢蒿群系>盐生假木贼群系>白梭梭群系;土壤真菌α多样性排序为:盐生假木贼群系>伊犁绢蒿群系>白梭梭群系;年均降水量和土壤有机碳是影响细菌群落组成和多样性特征最主要的环境因子,而影响真菌群落组成和多样性特征最主要的环境因子是土壤p H。（5）在整个研究区域,植物物种多样性与草地生产力呈显著相关关系（P<0.05）,土壤细菌多样性与草地生产力虽呈“单峰”趋势,但相关关系不显著（P>0.05）。荒漠植物多样性和草地碳氮储量均存在线性和二次多项式的显著相关关系（P<0.05）,土壤细菌多样性均与草地碳氮储量呈显著相关关系（P<0.05）,且土壤细菌多样性与草地碳氮储量相关性系数较高,所以土壤细菌多样性能更好的预测草地固碳、固氮功能。