【摘 要】
:
癌症已经成为威胁人类生命健康的主要疾病之一,高效的基因选择方法可以有效识别和分析基因表达谱中的致病基因,为癌症的预防和治疗提供重要的参考。基因表达谱具有高维度、小
论文部分内容阅读
癌症已经成为威胁人类生命健康的主要疾病之一,高效的基因选择方法可以有效识别和分析基因表达谱中的致病基因,为癌症的预防和治疗提供重要的参考。基因表达谱具有高维度、小样本的特点,一般的基因选择方法在一定程度上可以缓解维度过高带来的压力,但样本数量的匮乏仍然导致大部分的基因选择方法效果不佳,目前的研究方法主要集中于降维算法的改进,对于样本量方面的研究缺乏关注。针对上述问题,本文利用基于生成对抗网络(GAN)与群智能算法(SI)结合的方法进行基因选择,该方法通过生成样本提高基因表达谱数据集的样本量,并通过群智能算法优秀的搜索性能获取更优的基因子集,为基因表达谱数据的研究工作提供了一种新的思路。本文的主要工作如下:(1)针对传统基因选择方法的缺陷,本文提出基于条件约束的生成对抗网络与二进制粒子群优化(BPSO)的基因选择方法(y-CGAN-BPSO-ELM)。该方法针对基因表达谱数据的特点,首先利用CGAN模型进行样本生成,同时在判别器模型中加入对条件变量y的约束项,提高生成样本的真实性与多样性,最后对样本增加后的数据集以BPSO算法进行基因选择,以超限学习机(ELM)的分类结果指导选择过程。在多个基因表达谱上的实验结果证明,该方法能有效生成表达谱样本,并选择出具有较高分类准确度的基因子集。(2)针对生成模型在多分类问题中,出现的模式崩溃、收敛过慢及收敛至局部最优的问题,提出基于双重判别器的CGAN与群智能优化的基因选择方法(DDCGAN-ABPSO-ELM)。该方法在GAN模型的基础上提出具有双重判别器(Double Discriminator)的生成模型,利用两个判别器设置生成样本的真实性与多样性权重,获得具有更高真实度且分布更均匀的基因表达谱样本,随后结合粒子群算法(PSO)与人工蜂群算法(ABC)的搜索优势,通过种群共享机制提高基因选择时的搜索范围与收敛精度。在多个二分类及一个多分类的基因表达谱数据上的实验结果证明,该方法能够同时解决基因表达谱维度高、样本量少的问题,生成具有更高真实性与多样性的样本,选择出分类性能更高、相关性更强的基因子集。(3)基于本文所提算法,设计并实现了基于生成对抗网络和群智能优化的基因选择系统,实现了利用不同的基因选择方法对不同的基因表达谱数据集进行特征选择,并展示选择的基因子集及其分类性能。
其他文献
重污染企业具有高消耗、高排放、高污染等特点,通过排放废气、废水、废渣、噪声等污染物,给周围生态环境造成了一定程度的破坏。如何有效驱动重污染企业开展环境创新行为,是
目的:目前对不能手术又无远处转移的食管鳞癌的标准治疗是双药化疗同步放疗。放疗联合双药化疗毒性反应严重,而单药化疗副作用较低,但疗效如何,尚无临床实验来回答。因此我们设计S-1(替吉奥)同步放疗对比S-1联合顺铂同步放疗治疗食管癌的II期临床试验,来了解单药组的近期疗效是否不劣于双药组。方法:将患者按1:1随机分成2组。放射治疗均为:PTV(planning target volume,计划目标体积
柴油机燃烧过程是柴油机动力产生的决定性过程。柴油机燃烧过程含有丰富的柴油机状态信息,对柴油机燃烧过程进行检测,可检测出柴油机燃烧过程中可能出现的燃烧不良及其诱发的故障。常见的柴油机燃烧过程检测方法有三种:瞬时转速法、缸内圧力曲线法和振动信号法。其中,由于传感器限制,瞬时转速法难以对于高转速柴油机进行检测;而缸内圧力曲线法压力传感器昂贵且难以实现非侵入式检测,故无法实现大规模的工业应用;振动是柴油机
近年来,随着科技的不断发展与进步,铟锡合金(In-Sn)作为一种制备透明导电氧化铟锡膜(TCO)的重要材料,已被应用于航空、航天、电子等技术领域。铟锡合金薄膜的制备与其它普通合金薄膜的制备大同小异,但目前有关铟锡合金薄膜择优取向生长的制备方法和其性质研究的报道还没有。因此,对铟锡合金薄膜的制备、生长机理以及光电性能的研究,在未来半导体等各方面应用市场具有重要意义。另外,铟锡合金薄膜除了上述特性外,
近年来随着科学技术的不断进步以及人们生产生活方式的转变,室内移动机器人已经进入发展快车道,开始从传统工业应用领域走向多样化商业服务,从小规模试用阶段踏入大批量生产
产能过剩背景下,我国东部沿海地区制造业产品的国内外有效需求呈现下滑之势,经济效益下行压力增大,由此引发的劳资矛盾增多,劳资冲突日益直接化和尖锐化,劳资纠纷引发的群体
我国全民医保的基本实现同时也带来了许多问题,如流动人口的基本医疗保险异地就医结算。人口跨区域流动规模随着我国城市、城镇化持续建设不断加快呈逐年增长趋势。人口流动
目的:探讨Beck指数及椎体高度恢复率与随访椎体高度丢失率的相关性方法:回顾2015.1到2019.1月因为骨质疏松压缩性骨折(OVCF))在我院行PKP术(L1))并且获得随访的病例107例。收集病例资料,其中包括年龄、性别、术椎术后前缘高度恢复率,Beck指数,及术后第3个月、6个月术椎前缘高度丢失率。对上述资料采用多元线性回归分析探究术椎术后前缘高度恢复率及Beck指数对术椎第三、第六个月前
甲醛是一种无色具有刺激性气味的有毒气体,长期接触对人体伤害很大,生活中主要存在于家装材料中。开发低检出限快速响应的甲醛传感器具有重要意义。氧化锡(SnO_2)是一种n型宽禁带半导体,禁带宽度为3.5-4.0 eV。是一种重要的气敏材料,被广泛用于各种有害及易燃气体的检测和感知。然而,SnO_2单体存在灵敏度低、选择性差等缺点。研发高灵敏度、优异选择性的复合甲醛气敏材料具有重要意义。本课题以SnO_