本文以浙江省八大水系、五大湖泊的农业水污染生物技术的应用为基点，以八大水系和五大湖泊以外的河流、湖泊、地下水等水域为落脚点。考察了具有代表性的古镇景点西塘、县级市临安高等院校、地级市杭州城区等地区中农业水污染生物技术应用状态，通过文献搜索梳理了生物领域分子生物理论和技术、微生物发酵技术、生物工艺等专业知识、技术和创业公司、企业经营水平与建构标准；根据我国农业水环境污染和生物技术应用从微观理论探讨和实验室技术应用治理农药、氮、磷、重金属等污染物质到宏观村落、养殖场、河流、湖泊、东西部、南北方等不同层次上生物技术的应用现状，做出了归纳和总结；在此基础上，提出了浙江农业水污染生物技术治理应当以点源生物工艺治理为主、面源净化修复为辅的应用策略并推论出我国农业水污染中的生物技术发展趋势和农业水污染生物技术治理的发展方向。具体操作过程中统筹规划西塘古镇、临安高校、杭州城区，浙江省八大水系、五大湖泊，我国境内长江、黄河及其他大型湖泊三个层次生物技术的应用;认真核验从实验室与科学理论思维，到设备工艺的设计、制造与量产，到点、局部、区域生物技术应用中的技术可行性;稳步实施实验室技术与科学理论，到设备工艺的设计、制造与量产，到市场货币兑换，到高等院校与科研机构及农业水污染终端应用的平台建设货币方案，以期实现农业粮食生产安全、生产者居住安全和环境友好的农业水环境和生物技术产、学、研的良性发展。