菊花干旱响应转录组分析及CmDBBs亚家族基因的功能鉴定

来源 :中国农业大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:taiyangkaimen
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
菊花在世界范围内是重要的观赏植物种类,广泛应用于切花、盆花及城市景观绿化中。干旱胁迫严重影响菊花的栽培生产和推广应用,限制了它的产量和分布。为了获得菊花的功能基因组数据资源并更深入的理解菊花响应失水胁迫的分子机理。我们运用nlumina测序技术对失水胁迫处理的菊花植株[Chrysanthemum×morifolium(Ramat.)Kitamura] ’Fall Color’ 进行高通量转录组测序,并筛选出四个响应非生物胁迫的DBB家族成员基因,对这些基因进行表达特性及生化特性分析,并通过在模式植物拟南芥中过表达对其进行功能鉴定。取得以下主要研究结果:1)分别构建了失水胁迫处理下的菊花幼苗和对照的cDNA文库,并使用Illumina测序技术进行测序。一共获得超过一亿个reads,并通过从头组装获得98180个唯一的转录本,并通过与其他蛋白数据库进行序列比对进一步对这些序列进行了注释。根据这些转录本序列进行了生化途径的预测。2)对失水处理的菊花数据进行基因表达谱分析并鉴定了 8558个失水响应的转录本,其中包括307个转录因子和229个蛋白激酶以及众多已知的胁迫响应基因。基因本体论(GO)富集和生化途径分析表明失水胁迫引起了植物激素响应、次级代谢物、氨基酸代谢及光与光周期响应的改变。这些发现显示菊花的干旱耐性可能与激素生物合成和信号转导的调节、降低氧化伤害、稳定细胞蛋白和结构以及维持能量及碳供应有关。3)我们在转录组中识别了 4个DBB亚家族成员,分别命名为CmBBX19、CmBBX22a和CmBBX22bBBBX22c。RT-PCR分析表明CmBBX19主要集中在叶片、花和茎中表达,CmBBBX22a主要在花中表达,CmBBX22b和CmBBBX22c则是在叶和根中表达较高。胁迫处理分析表明,CmBBX22b受失水胁迫诱导,而CmBBBX22aa和CmBBX22c被失水胁迫下调;CmBBX19和CmBBX22c明显受到低温诱导;但该家族基因不受盐胁迫诱导。4)洋葱表皮瞬时表达系统分析表明CmDBBs均定位在细胞核中,酵母转录激活实验表明CmBBX22a、CmBBX22b和CmBBX22c具有转录激活能力且转录激活区域在蛋白的中段而不是C末端和N末端的B box区域,而CmBBX19并没有发现具有转录激活能力。CmBBX22a、CmBBX22b和CmBBX22c受蛋白酶体降解,但甘露醇处理可以提高CmBBX22b蛋白稳定性。5)获得拟南芥CmDBBs过表达株系,发现过表达CmDBBs家族基因均影响拟南芥开花时间,同时叶片离体失水率及干旱处理试验表明,CmBBX22b过表达株系具有较强的耐失水能力,而CmBBX19、CmBBX22aa和CmBBX22c过表达株系降低了耐失水能力。本研究所获得的转录组序列可以为菊花抗性育种提供有价值的基因数据资源,并发掘了众多的候选基因及标记基因,为将来培育干旱耐性菊花品种奠定了工作基础。发掘的1个DBB亚家族基因将为菊花干旱胁迫耐性的种质资源改良提供候选基因。
其他文献
回 回 产卜爹仇贱回——回 日E回。”。回祖 一回“。回干 肉果幻中 N_。NH lP7-ewwe--一”$ MN。W;- __._——————》 砧叫]们羽 制作:陈恬’#陈川个美食 Back to yield
社区教育是终身教育的重要途径之一,社区教育涉及的范围较广,并且能够通过日常生活影响社区的成员。在当今社会,信息化程度不断提高,网络教育不断发展,信息化教育也与社区教
全球化法律发展理论的逻辑起点是法律文化的传播,法律文化的传播为法律全球化的形成和发展提供了内在基础和驱动力量,而法律的全球化发展势必会影响世界范围内的社会发展与变
结球甘蓝是我国的一种重要蔬菜,栽培面积已达几十万公顷,但结球甘蓝病害相当严重,常给广大菜农造成极大经济损失。在我国,有关结球甘蓝的抗病育种研究取得.了很大的进展,已选育出不
目的:探讨老年上消化道出血患者应用整体护理的护理效果。方法:选择老年上消化道出血的患者100例,根据入院顺序随机分成对照组与观察组各50例,对照组患者给予常规护理,观察组则
目的:探析腹腔镜联合宫腔镜治疗输卵管性不孕症的临床治疗效果。方法:将30例输卵管性不孕症患者随机分为观察组与对照组,每组15例,观察组采用腹腔镜联合宫腔镜治疗,对照组采用
俄罗斯联邦档案署以开放数据为核心,制定了至2018年的开放机制计划,首次设立了公共委员会并组织召集了顾问组,对于促进俄罗斯联邦档案决策的自由、公平和透明具有重要意义。