近年来，我国SARS和禽流感等突发性公共卫生事件爆发频繁，不同地区以及城乡之间公共卫生服务提供水平和覆盖面存在巨大差异，这些现实问题都与政府公共卫生支出的公平性与效率密切相关。研究公共卫生支出的公平与效率，对缩小地区以及城乡之间公共卫生状况差异，三农问题的解决，弱势群体地位的改善，社会正义的倡导以及提高公共卫生的配置效率和公共卫生服务的提供效率都是大有益处的。本文把公共卫生支出作为研究对象，通过对我国公共卫生支出公平和效率的分析，得出对公共卫生支出结果的基本评价，并从公共财政和医疗体制改革等角度提出政策建议。按照公共支出分析的财政理论，本文对公共卫生支出的分析是按照以下的思路来进行的：政府为什么要负担公共卫生支出?我国目前的公共卫生支出规模是否合理?公共卫生支出的结构是否存在偏差?这是对公共卫生支出进行评价的基础。我国公共卫生支出分配是否公平?公共卫生支出的效率如何?这是对我国公共卫生支出的结果进行评价的核心内容。本文共分为五个部分：导论，提出整篇文章所要研究的问题，并在总结已有的研究成果的基础上，将本文的定位明确为对公共卫生支出的公平与效率的分析，同时分部分概括了全文的主要内容。第一部分系统介绍了公共卫生、公共卫生支出等相关概念，简要分析了政府介入公共卫生领域的理论依据，并从总体上分析了我国公共卫生支出的规模与结构，对我国公共卫生支出现状进行了勾勒与概括，为本文的研究切入点和方法选择做了必要的铺垫。第二部分提出了评价公共卫生支出公平分配的两个原则，并通过对卫生服务的利用，卫生服务的可及性以及我国城乡居民健康状况的实证分析，得出我国公共卫生支出分配不公平的结论，并对不公平的原因进行了分析，提出地区之间经济发展水平的差异，公共卫生财政体制和公共卫生转移制度的缺陷是造成我国公共卫生支出不公平的主要原因。第三部分对我国公共卫生支出的配置效率和提供效率进行了分析，得出了我国公共卫生支出缺乏效率的结论，并对缺乏效率的原因进行了分析，得出我国市场化改革导致卫生资源配制效率低下，公共卫生支出存在不公平，公共卫生支出结构不合理以及预算体制的缺陷降低了公共卫生支出的效率的结论。第四部分概括全文分析得出的主要结论：我国公共卫生支出分配不公平，公共卫生支出的效率有待提高。然后针对这些问题提出完善我国公共卫生支出的政策建议，主要包括：明确政府职责，合理确定公共卫生支出的规模与结构：完善转移支付制度：加大农村公共卫生支出力度；改革我国预算体制及医疗卫生体制。