【摘 要】
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肺癌是目前全球发病率和死亡率最高的恶性肿瘤,严重威胁人类的健康和生命安全。云南宣威是我国肺癌发病率最高的地区之一,具有独特的区域流行病学特征。由于宣威肺癌的高度恶性,并且缺乏有效的分子标准物,大部分宣威肺癌患者初次确诊时已处于癌症晚期,错过了治疗的最佳时机,因此,对于宣威肺癌发病机制的研究极为迫切。然而,目前对于宣威肺癌发生发展分子机制的研究非常有限,并且还有许多重要的基因未被发现。因此,鉴定宣威
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肺癌是目前全球发病率和死亡率最高的恶性肿瘤,严重威胁人类的健康和生命安全。云南宣威是我国肺癌发病率最高的地区之一,具有独特的区域流行病学特征。由于宣威肺癌的高度恶性,并且缺乏有效的分子标准物,大部分宣威肺癌患者初次确诊时已处于癌症晚期,错过了治疗的最佳时机,因此,对于宣威肺癌发病机制的研究极为迫切。然而,目前对于宣威肺癌发生发展分子机制的研究非常有限,并且还有许多重要的基因未被发现。因此,鉴定宣威地区特有的差异表达基因,无论对于诊断生物标志物的研发还是肺癌发生发展分子机制的揭示都具有重要意义。本研究采用高通量转录组测序（RNA-Seq）对宣威肺癌中癌症组和癌旁组的m RNA进行比较研究,并利用生物信息学方法对非宣威肺癌（中国其他地区）的m RNA高通量转录组数据进行整合分析,通过将宣威肺癌与非宣威肺癌得到的差异表达m RNA进行对比,获得与宣威肺癌发病相关的关键基因,并通过差异m RNA的功能聚类、信号通路及其所对应的蛋白成员之间的相互作用网络。通过对各差异表达基因进行相关文献检索,我们选取了6个候选基因（APLN、GPX3、DLL4、ITGB8、ABCB1、SULF1）并通过q RT-PCR验证它们在宣威肺癌样本中的表达水平,其结果均与m RNA测序结果相符。此外,我们通过ROC曲线对候选的差异表达基因进行临床诊断价值进行评估。结果表明,除ITGB8外,APLN、GPX3、DLL4、、ABCB1、SULF1对宣威肺癌均具有重要的诊断价值。总之,本研究通过对宣威和非宣威地区肺癌患者的高通量转录组数据进行整合分析,对宣威肺癌的关键基因进行初步筛选,有助于了解宣威肺癌的遗传分子及其调控机制,为宣威肺癌的诊断和深入研究提供一定的基础。
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