马铃薯晚疫病水平抗性相关基因中未知功能基因的定位

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马铃薯(Solanum tuberosum L.)是世界上四大粮食作物之一,地位仅次于水稻、小麦和玉米。中国是最大的马铃薯生产国。由致病疫霉菌(Phytophthora infestans)引起的晚疫病是马铃薯全球范围内的毁灭性病害,严重地制约了马铃薯的生产和发展。最初人们使用化学药剂进行防治,取得了一定的成效,但是化学药剂不仅价格昂贵,而且还对环境造成了一定的污染。因此,培育抗性品种成为晚疫病防治的最有效途径。由主效基因控制的马铃薯晚疫病垂直抗性并不持久,因为新产生的小种会迅速克服这种单基因抗性。与垂直抗性相反,水平抗性是由微效多基因控制的数量性状,具水平抗性的品种虽会发生一定程度的病害,但没有病原小种的特异性,对品质和产量影响较小,抗性较为持久,且对晚疫病菌的选择压小,可以延缓病原菌的变异。因此,培育抗晚疫病的水平抗性品种已成为目前全球抗晚疫病育种的趋势。控制水平抗性基因的复杂性与病原菌和环境的复杂互作,以及马铃薯栽培种本身的四体性遗传,使得水平抗性育种十分困难。本研究从实验室已鉴定的348个马铃薯晚疫病水平抗性相关基因EST中筛选未知功能基因的EST,通过群体多态性检测进行基因定位,根据定位情况预测其功能,从而为开发马铃薯晚疫病抗性相关的分子标记奠定基础。主要研究结果如下:1.本研究从实验室已鉴定的348个EST筛选了与马铃薯晚疫病水平抗性相关的未知功能基因的EST35个。2.根据已知的EST序列设计特异引物,同时检测这些引物在两个二倍体马铃薯群体中的多态性。本实验选用的两个群体都是回交群体,分别是BCT群体和PCC1群体。多态性结果显示,2个标记在PCC1群体中有多态性,5个标记在BCT群体中有多态性。3.将具有多态性的7个标记回收、测序,然后在NCBI上进行Blast分析。结果表明,6个为目标基因,分别是DR751788、DR751719、DR751998、DR752001、DR752011和DR751984,1个为非目标基因。4.用作图软件定位这7个多态性标记,DR752011定位到PCC1遗传图谱的第8号染色体上;DR751719、DR751984、DR752001和DR751998分别定位在BCT遗传图谱的第6、12、1和4号染色体上。通过与已知图谱中的晚疫病水平抗性相关QTL比对,这些基因都不位于QTL区域。
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