目的用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱系统检测正常健康人，慢性肾功能衰竭患者，移植物功能正常的长期存活者，慢性移植物肾病患者血清蛋白质指纹图谱，构建慢性移植物肾病新的预警诊断系统。方法用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱系统及弱阳离子表面交换芯片检测移植肾功能完全正常的长期存活者，健康者，慢性肾功能衰竭患者和慢性移植物肾病患者血清蛋白质指纹图谱，并运用美国赛弗吉公司提供的Biomarker Wizard和Biomarker Pattern软件判别和分析处理数据，筛查特异的蛋白质分子标志物。结果在慢性移植物肾病患者组和移植肾功能完全正常的长期存活者组，检测出85个有意义的蛋白质峰，15个蛋白质峰表达差异有意义(p＜0.05)，质荷比(2476.0，3078.7，3190.5，4076.5，4506.0，6178.4)的6个蛋白质峰在两者间表达有极其显著差别(p＜0.01)，以质荷比3078.7为单一分子标志物可区别移植肾功能完全正常的长期存活者和慢性移植物肾病患者(p=0.0001)，它在前者高表达，在后者低表达，其构成的决策树结构为2个终结点的分支树模式，其敏感性为87.5％，特异性为81.8％，单一生物标志物在区分慢性移植物肾病和移植物功能正常的长期存活者的作用权重为100，其它蛋白质的区分权重评分都低于100，以及产生区分作用的相对费用为0.307，获益可能达到1。结论SELDI-TOF-MS系统检测的生物大分子标志物在揭示复杂疾病的机理和建立新的诊断模式方面具有很高的应用价值。