miR-150调控TIM-3在小鼠巨噬细胞内毒素耐受中的作用机制研究

来源 :重庆医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sscy2002
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第一部分:TIM-3在小鼠巨噬细胞内毒素耐受时的表达  目的:筛选小鼠巨噬细胞在内毒素耐受时的差异基因,检测内毒素耐受时TIM-3的表达情况。方法:通过在基因芯片数据库 GEO中选择小鼠巨噬细胞内毒素耐受数据集:GSE47783;通过在线分析软件GEO2R筛选差异基因;DAVID进行基因功能注释分析;采用LPS处理小鼠巨噬细胞系RAW264.7构建内毒素耐受模型与脓毒血症组,ELISA检测 TNF-α在上清液中含量,选择内毒素耐受组中高表达 TIM-3进行RT-qPCR、WB、IF检测验证。结果:在小鼠内毒素耐受数据集GSE47783中共筛选出差异基因1219个,内毒素耐受上调基因684个,下调基因535个(纠正P<0.01),其中TIM-3在内毒素耐受组中显著增高(P<0.01);通过DAVID发现差异基因富集到:JAK-STAT、TLR、MAPK、等信号通路。内毒素耐受组上清液 TNF-α降低约1/3,差异有统计学显著性(P<0.01);与内毒素组相比,内毒素耐受组TIM-3在2、4、6、8h时表达增加,并在4h时到达高峰;与内毒素组相比,4h时内毒素耐受组TIM-3的mRNA表达增加(P<0.05);TIM-3位于巨噬细胞膜表面。结论:内毒素耐受时,TIM-3 mRNA、蛋白表达增高。膜蛋白TIM-3可能在内毒素耐受的产生机制中可能具有重要作用。  第二部分:基于通过生物信息学方法探讨 TIM-3在内毒素耐受中的作用机制研究  目的:探讨 TIM-3在内毒素耐受中的作用机制。方法:通过慢病毒载体构建 TIM-3干扰载体,并设置阴性对照组;建立稳定表达巨噬细胞株:TIM-3 KD组与TIM-3阴性组。通过GEO网站找到TIM-3敲低后的miRNAs的芯片数据GSE76839,再通过GCBI在线软件预测出靶基因并根据靶基因进行信号通路富集分析。WB验证敲低细胞株的效果;RT-qPCR验证所筛选的信号通路关键基因、巨噬细胞极化相关基因以及效应因子TNF-α、IL-1β的mRNA水平。结果:TIM-3慢病毒干扰载体构建成功后并建立了稳定表达细胞株(TIM-3 KD组与TIM-3阴性组)。通过GCBI共筛选出上调miRNAs13条、下调miRNAs13条(P<0.01);通过TargetScan及 miRanda在线软件共预测出靶基因1774条;主要富集到MAPK、WNT、HIPPO等多条信号通路。在4h时与阴性组比较, MAPK、WNT、HIPPO信号通路关键基因在TIM-3 KD组表达增高(P<0.05);在内毒素耐受4h时与阴性组比较,TIM-3 KD组中炎症因子TNF-α、IL-1β表达增高(P<0.05);M2相关基因ARG1、CD206表达降低(P<0.05);M1型相关基因NOS2表达未见差异。结论:TIM-3通过相关miRNAs调控MAPK、WNT、HIPPO等信号通路,促进巨噬细胞向M2型转化,并减少炎症因子TNF-α、IL-1β表达,促进巨噬细胞内毒素耐受形成。  第三部分:miR-150调控TIM-3在内毒素耐受中的机制研究  目的:探索 TIM-3的 miRNAs转录后调控机制,筛选直接作用于TIM-3的miRNA。方法:通过miRNA.org与Targetscan7.1预测出可能的miRNAs;通过LPS构建小鼠巨噬细胞脓毒血症与内毒素耐受模型,通过RT-qPCR检测两组中的目标miRNAs与TIM-3的表达量;根据初步筛选的 miRNA构建 miR-150的模拟物 mimics,并设置阴性对照组;mimics通过脂质体2000法转染小鼠巨噬细胞系,再次通过 RT-qPCR检测TIM-3的mRNA水平;双荧光素酶报告实验验证miR-150与TIM-3的直接转录后调控关系。结果:通过生物信息学方法共预测出miR-150/212/34a等15个miRNAs;通过RT-qPCR检测发现miR-150与TIM-3在各组中呈现负性相关性;于阴性对照 mimics相比,miR-150的mimics在转染细胞后导致靶基因TIM-3的mRNA水平降低;双荧光素酶报告实验证实:miR-150与TIM-3有直接作用关系。结论:内毒素耐受中miR-150通过转录后调控直接抑制TIM-3的mRNA水平。
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