煤炭资源是人类社会赖以生存的物质基础，是先进生产力发展的重要标志，是国家综合国力的具体体现。我国“缺油、少气、富煤”的能源结构更加决定了煤炭资源在我国国民经济发展中的战略地位。因此，煤炭行业的可持续发展关乎着我国经济的持续、稳定、高速发展。而科学的煤炭税费制度不仅能增强企业竞争力，促进煤炭行业健康发展，还能节约资源，保护环境，推动社会、资源、环境和谐统一。我国的煤炭税费制度经过不断地完善，逐步形成了以增值税、所得税、资源税、资源补偿费为主，专项基金及其他费用为补充的税费体系。但是，随着经济格局的不断变化，我国煤炭税费制度已呈现出越来越多的问题，严重制约着煤炭行业的健康发展。本文首先从产权理论、外部性理论、资源耗竭性理论、可持续发展理论四个方面阐述了煤炭税费的理论基础，从根源上分析了煤炭税费体系的制定依据；然后介绍了我国煤炭税费制度的演进及现状，从整体上感知了煤炭税费的改革历程和现行体制；接着选取税费制度中具有代表性的增值税、资源税、费三个税费进行问题分析，通过定性与定量分析深入探讨了问题形成的原因及造成的后果；最后，针对我国煤炭税费制度存在的问题，提出了税费制度改革的具体措施。