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细菌耐药性是目前全人类面临的最紧迫的公共卫生问题之一。耐药基因作为一种新型污染物质,在环境中的迁移和归趋日益受到研究者的关注。四环素在我国的禽畜养殖业中用量较大,是一种典型的广谱抗生素,对四环素耐药基因的分型和耐药机制研究的较为透彻,但对耐药基因在环境中迁移、归趋规律等的研究还远远不够。因此,本研究以四环素耐药(tet-R)基因和乳糖发酵型肠杆菌(LFE)为研究对象,采用传统微生物培养技术和现代分子生物技术,研究了上海市2家养猪场和养鸡场的禽畜粪便、粪便堆肥和施用堆肥土壤中耐四环素乳糖发酵型肠杆菌(TR-LFE)中四环素耐药基因的分布以及禽畜粪便、堆肥和土壤中四环素耐药基因的变化,得出以下结论：(1) TR-LFE/LFE比值在猪粪、猪粪堆肥和施用猪粪堆肥的土壤中呈逐级降低趋势,在鸡粪和鸡粪堆肥中也是如此。(2)分别从养猪场样品中和养鸡场样品分离出540株和340株TR-LFE,选取不同耐药机制的10种tet-R基因的特异性引物,采用普通PCR方法对分离菌株进行了tet-R基因的检测,发现养猪场样品中的485株和养鸡场样品中289株TR-LFE携带有1种或1种以上的被检测的tet-R基因。(3)养猪场分离的TR-LFE中10种tet-R基因的平均检出率的顺序tet(A)> tet(B)> tet(M)> tet(G)> tet(C)> tet(D), tet(S)> tet(O)> tet(X)>tet(E)。养鸡场分离的TR-LFE中10tet-R基因的平均检出率的大小顺序为tet(A)> tet(B)> tet(M)> tet(D)> tet(G)> tet(O)> tet(C)> tet(E), tet(S), tet(X)。外输泵基因tet(A)、tet(B)和核糖体保护蛋白基因tet(M)是本研究中分离的TR-LFE菌株中最主要的tet-R基因。(4)养猪场分离的TR-LFE中,tet(A)+tet(B)、tet(A)+tet(M)和tet(B)+tet(M)是检出率最高的双重tet-R基因型；tet(A)+tet(M)和tet(A)+tet(B)是鸡粪和堆肥中分离的TR-LFE菌株中双重tet-R基因检出率最高的类型。不同来源的TR-LFE中携带单重tet-R基因的检出率顺序为幼猪粪>成猪粪>土壤>猪粪堆肥,多重tet-R基因的检出率的大小顺序为猪堆肥>土壤>成猪粪>幼猪粪。猪粪堆肥中分离的TR-LFE不仅多重tet-R基因检出率是最高的,而且多重耐药基因的种类也是最多的。猪粪堆肥和鸡粪堆肥中分离的TR-LFE中的单重tet-R基因的种类也最多。(5)养猪场各样品抽提获得的总DNA中tet-R基因的检出率大小顺序为成猪粪>幼猪粪>猪粪堆肥>土壤；养鸡场中各样品抽提获得的总DNA中tet-R基因的检出率的大小顺序为成鸡粪>幼鸡粪>鸡粪堆肥。(6)采用荧光定量PCR方法对养猪场和养鸡场样品中所含的tet(A)和tet(C)基因的含量进行检测,结果表明猪粪堆肥中tet(A)和tet(C)基因的含量比新鲜猪粪中的低0～3、1～4个数量级,土壤中的tet(A)和tet(C)的含量比猪粪堆肥中的均低0～1个数量级。鸡粪堆肥中tet(A)和tet(C)的含量比新鲜粪便中的分别减少了0～4、1～3数量级。据此推测tet-R基因在粪便、堆肥和土壤中呈逐级降低的趋势,堆肥过程可能有利于tet-R基因含量的降低。