鸭源性传染性支气管炎病毒ZZ2004株全长cDNA感染性克隆的构建

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禽传染性支气管炎病毒(IBV)以引起鸡的呼吸道症状,肾脏损害,产蛋量和蛋的品质下降为特征的冠状病毒。鸭源性IBV ZZ2004是分离于以引起免疫抑制和生长抑制为主要症状的鸭群,感染肉仔鸡群也引起同样症状。本研究是在全基因组测序和序列分析基础上,构建IBV ZZ2004感染性cDNA克隆。为进一步在分子水平上研究其基因组功能﹑病毒复制机制、分子致病机理以及发展新型疫苗奠定基础。根据IBV ZZ2004毒株的全基因序列,借助DNA Star软件分析,选择全长基因组核苷酸序列中单一限制性酶切位点,设计合成4对引物,利用长距离RT-PCR方法,扩增出4个cDNA重叠片段,N1片段上游引入了T7启动子:N1(1nt~5954nt)、N2(5860nt~12491nt)、N3(12434nt~20930nt)、N4(20717nt~27673nt),分别克隆到pGEM-Teasy载体上,通过JM109感受态细胞化学转化,得到了4个不同的重组质粒;4个重组质粒经双酶切鉴定和测序鉴定正确后,获得了一个包括4个cDNA片段的IBV ZZ2004毒株全基因组cDNA文库。再利用限制性内切酶分别对4个不同的重组质粒和pFastBacHTA载体进行双酶切,分别回收,将4个片段中的两两重叠片段与pFastBacHTA载体在22℃水浴锅中过夜连接,通过JM109感受态细胞化学转化,得到了2个不同的重组质粒,形成了只有2个大片段的IBV ZZ2004毒株全基因组cDNA文库。最后利用限制性内切酶分别对2个不同的重组质粒进行双酶切,分别回收,在22℃水浴锅中过夜连接,构建IBV ZZ2004毒株全长cDNA文库。根据IBV ZZ2004全基因序列,在全基因序列的前后两端和中端设计三对特异性引物,用于鉴定全长是否连接成功。前端G1片段的位置:1-476,长度:476nt;中端G2片段的位置:12245-12635,跨越链接位点,长度:391nt;末端G3片段的位置:27018-27673,长度:657nt,经PCR鉴定IBV ZZ2004全长cDNA构建成功。以线性化的IBV ZZ2004全长cDNA为模板通过体外转录试剂盒合成病毒RNA,纯化后,用RT-PCR检测其完整性,将病毒RNA直接接种于9日龄的SPF鸡胚尿囊腔中,37℃人工孵化至72h,收取鸡胚尿囊液连续传3代,用RT-PCR方法检测每一代病毒均为阳性,并测定第3代病毒的EID50为105.5/0.2mL,成功构建了IBV ZZ2004全长cDNA感染性克隆。
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