中国人一先天性巨结肠家系全外显子测序分析

被引量 : 0次 | 上传用户:raincy
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的采用新一代测序技术对一个汉族巨结肠家系中2例患者进行全外显子测序,测序数据进行多步骤过滤分析,初步筛选先天性巨结肠的易感基因。方法收集一个先天性巨结肠家系中母子2个患者的静脉血采用全外显子捕获和新一代测序技术进行高通量测序,测序结果与人类HAPMAP8,dbSNP130和1000Genome Project数据库进行比对过滤已报道的常见变异,再过滤掉同义突变,将母子单核苷酸非同义突变进行整合,并通过Sanger法测序排除外显子测序的假阳性结果,初步筛选出候选基因。结果测序结果通过原始质量评分过滤,母子两个患者共得到8.4G的数据。过滤掉不在外显子区域的单核苷酸变化(SNVs),落在外显子区域的单核苷酸变化数目母亲为13948个,儿子为13856个;过滤掉公共数据库(HAPMAP8,dbSNP130和1000Genome Project)的常见变异,落在外显子区域的未报道的单核苷酸变化数目母亲为3472个,儿子为3345个;过滤掉同义突变,非同义突变的单核苷酸变化数目母亲为470个,儿子为458个;整合母子两个共有的非同义突变数目筛选出17个基因。Sanger法排除外显子测序C22orf42(G>A)假阳性结果,最后得到16个候选基因。结论NRG3;LAMA3;BRIP1;JARID2; KRT6A;LEPREL1;OR8J3;PLA2G4C;PRBP4;RNF10;SPRY1;TMPRSS11E;VARS2;NBPF16;GSTM4;PRSS116个基因可能为巨结肠的易感基因,但须进一步确认。
其他文献
19世纪下半期的上海,曾出现过英语学习和英语读物出版的热潮.有关这一时期上海掀起的"英语热",熊月之、张敏的<上海通史@晚清文化>一书曾有论及.
产品模块化设计是一种以产品功能模块为基础,进行模块组合优化及布局、模块化外观造型创新设计的一种现代化设计方法,在现代产品创新与开发过程中发挥着极其重要的作用。它涉及
现在,全世界范围内都非常关注能源、环境及可持续发展问题,目前,我国仍然是以燃煤为主的发展中国家,这种不合理的能源结构已经造成了能源的日益枯竭与环境的逐渐恶化。因此,寻求一
城市交通峡谷是城市户外空间的重要组成部分,它是指由城市临街建筑物与城市道路围合而形成的,类似于“峡谷”的狭长型户外空间。城市交通峡谷是人们户外活动最为活跃的场所之一
进入21世纪,环境问题越来越受到人们的重视,可持续发展成为世界各国共同的发展战略。中国当前正处于快速城市化的阶段,大量人口涌入城市,住宅需求量持续增长,但大量建设的城市住宅
李传玺在第6期的《环球》上介绍:美国不少地方有“农夫市场”,那是地方政府为照顾贫困人口,特意在固定地点、固定时间开设的。我在洛杉矾就见过这么一处。一天上午,我们去洛杉矾
<正>临床上,扁桃体和腺样体疾病一直困扰着儿童的身心健康。治疗除保守方法抗炎及对症治疗外,手术切除病变组织是重要的处理手段。众所周知,扁桃体和腺样体在人体内具有免疫
作为斜拉桥的主要承重构件之一,斜拉索具有跨度长、重量轻、柔度大和阻尼低等结构特点,很容易在外界干扰下发生各种机理的振动。当拉索固有频率与桥的固有频率成一定比例时,桥面
高速公路作为交通运输方式的一种,在城市的对外交通中发挥着举足轻重的作用,是城市之间和城市与周边地区联系的纽带。随着社会经济的飞速发展,城市空间也发生了很大的变化,高速公
本文以尼龙66为基础树脂,核-壳结构的硅橡胶为增韧剂,圆形玻璃纤维和扁平玻璃纤维为增强材料,无卤阻燃剂为阻燃材料,制备了阻燃复合材料。采用万能拉伸仪,摆锤冲击仪和UL-94测试