鹅A-FABP基因克隆与多态性分析

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脂肪型脂肪酸结合蛋白(Adipocyte Fatty Acid-Binding Proteins,A-FABP)是脂肪酸结合蛋白中的重要因子,在哺乳动物中只在脂肪组织中表达。哺乳动物的A-FABP是甘油三酯的贮存库,在甘油三酯的形成以及脂溶解的过程中A-FABP储存或释放出大量的脂肪酸,还具有调节作用:影响细胞内信号转导和基因转录;改变细胞内氧化还原电位;改变细胞内与代谢相关的酶的活性;增加脂肪酸在膜间的扩散,从而参与调控脂生成及溶解的生化循环。 本试验以五龙鹅和朗德鹅为研究对象,克隆了A-FABP基因内含子2和3的完整序列,并用3种不同的酶酶切PCR产物,与鹅的肥肝性能进行统计分析,对其内含子3的序列进行同源性分析和酶切分析,并利用Real-time PCR技术检测了A-FABP基因在脂肪、肝、腿肌等10种组织中的表达情况。结果如下: 1.根据鸡(AF432506)、鸭(DQ358123)、人(NM001442)、猪(SSY16039)等的A.FABP基因保守序列设计引物,运用PCR法从五龙鹅和朗德鹅血液中克隆了A-FABP基因内含子2序列,长461bp(GenBank登录号为DQ647701)。并用RFLP的方法对其进行遗传多态性研究,该扩增产物经Asp Ⅰ、Hinf Ⅰ和HaeⅢ酶切后,发现有HaeⅢ-RFLP,并出现AA、AB和BB 3种基因型,其五龙鹅和朗德鹅的基因型频率分别为0.7、02、0.1与0.372、0.465、0.1 63。经X<2>检验,五龙鹅和朗德鹅在A-FABP位点上处于Hardy-wleinberg平衡状态(P>0.05)。分析基因型与鹅体重和肥肝性状时发现:基因型对五龙鹅体重无显著影响(P>0.05),而对填饲的朗德鹅体重和肥肝性状有显著影响(P<0.05)。填饲的朗德鹅在体重和肥肝性状上基因型AA与AB和BB之间存在显著差异(P<0.05),而五龙鹅在体重性状上3种基因型差异不显著(P>0.05)。在研究指标中两种鹅的AA基因型效应均大于AB和BB基因型。表明,这些差异的不同可能反映了品种之间不同的遗传特性。A-FIABP可能是影响鹅肥肝性状的主效基因或与主效基因相连锁,可用于更多鹅肥肝性状的标记辅助选择。 2.根据鸡的(AF432506)、鸭(DQ358123)等发表的编码区序列设计兼并引物,从五龙鹅和朗德鹅基因组的DNA中克隆了包括内含子3的序列,长1361bp(序列已提交GenBank),其中完整的内含子3长1278bp。鹅A-FABP基因内含子3与鸡的同源性达到了75.0%。获得的序列与鸡相比发生了60个碱基缺失和274个碱基替换,鸡相对鹅发生了51个碱基缺失和283个碱基替换。通过对鹅A-FABP基因内含子3的基因组序列进行酶切分析发现有10种常见的限制性内切酶的酶切位点20处,并且用分析软件表明该片断适合进行酶切分析。 3.根据已测得的不同动物A-FABP基因的保守区设计引物,提取朗德鹅脂肪、肝、心、脾、肺、肾、胸肌、腿肌、睾丸、脑10种组织的RNA,利用Real-time PcR技术检测了A-FABP基因在10种组织中的表达情况。最佳反应条件为:SYBR Green Ⅰ终浓度为1×,退火温度为60℃时,此时,熔解曲线显示单峰且峰值单一。朗德鹅A-FABP基因在各组织中的表达量的关系为:肝>脂肪>腿肌>脾>肺>心>胸肌>肾>睾丸>脑。表明肝脏和脂肪的表达量处在最高的等级,腿肌、脾、肺、心处在第二等级,表达量次之,胸肌、肾、睾丸、脑处在第三等级,有微量的表达。
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