限期治理制度是环境管理制度的一种,在我国的建立和发展的过程中使其充满中国特色,在水污染防治领域内,限期治理制度有着举足轻重的地位,也做出了极大的贡献。但是,《水污染防治法》中的限期治理制度依然存在着一些问题导致其操作性较弱,对环境执法设置了一定的障碍。执法实践过程中,“限改令”逐渐被当做“护身符”来使用,导致很多被限期治理企业在限期治理期间不仅没有纠正违法行为,反而更加肆无忌惮的违法排放污染物。这样的行为造成了一定的负面影响。鉴于限期治理制度中存在的一些问题,本文在肯定限期治理制度存在价值的前提下,以限期治理制度在发展过程中呈现出来的问题为重点研究对象,提出相应的解决方案,解决限期治理制度适用范围是否缩小的异议,在公正的前提下追求效率而探索合乎实情的简易程序,在限期治理制度中引入代履行制度,并且强调法律责任对违法行为起到威慑作用和将法律责任落实到实处的重要性。