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作物核心种质指的是以最小的资源份数和遗传重复最大限度地代表其遗传多样性,构建核心种质可以克服和缓解庞大的资源规模所带来的相应困难和压力,为种质资源的保存、评价和创新利用提供便利以及节约成本。南瓜（Cucurbita moschata L.）在瓜类嫁接中有良好的表现,经过长时间的选育,出现了大量的砧用南瓜品种,其中不乏同名异物、同物异名现象,构建砧用南瓜核心种质有利于对优良砧用南瓜品种重点保存。本研究以203份砧用南瓜高代自交系为材料,以抗性系数为依据,评价它们对高温、低温、高盐的抗性能力,并根据它们的抗性水平,分为5个抗性类别,在每一个抗性类别中选取等比例的种质,在每组中优先选取综合抗性能力较强的种质,去除重复种质后,得到67份代表性种质进行抗性水平重复鉴定。再以抗性水平为分组依据,结合聚类优先取样的方法,获得初级核心种质,对初选核心种质进行SSR分析,构建出砧用南瓜核心种质,所构建的核心种质以最少的资源份数代表原始种质库。主要研究结果如下:1.以抗逆系数为依据初步评价了 203份砧用南瓜的抗性水平。对203份砧用南瓜材料,进行高温、低温以及高盐处理,以抗性系数（相对干重）为依据,进行UPGMA聚类分析,评价了 203份种质的抗逆性。将203份材料分为抗性种质、次抗性种质、中抗性种质、次敏感性种质和敏感性种质5类。高盐处理下,各抗性水平的种质分别占比0.99%、20.20%、19.70%、29.56%、33.50%;高温处理下,各抗性水平的种质分别占比1.98%、7.39%、14.29%、12.32%、64.04%;低温处理下,各抗性水平的种质分别占比 11.33%、3.94%、19.70%、42.36%、22.66%。2.采用隶属函数法重新评价了砧用南瓜抗性水平。按照优先选取综合抗性较高种质的原则,以5个抗性类别为基准,从203份砧用南瓜种质中筛选出67份代表性种质,进一步进行抗性鉴定。为确保不同砧用南瓜苗期抗逆性鉴定的准确性,以67个砧用南瓜品种为材料对苗期的的伤害指数、株高、茎粗、地上部鲜重和地上部干重,利用多元分析方法对不同砧用南瓜品种抗性能力进行综合评价。结果表明,高盐处理下,隶属函数分析得到不同种质苗期耐盐性综合评价值（D值）,聚类分析将67个砧用南瓜种质划分为耐盐、中等耐盐和不耐盐3种类型,其中18C0110和18C0178耐盐能力最强,18C0048和18C0117耐盐能力最弱,其余各种质耐盐性与初评价结果一致。高温处理下,隶属函数分析得到不同种质苗期耐热性D值,聚类分析将67个砧用南瓜种质划分为耐热、中等耐热和不耐热3种类型,其中18C0060耐热能力最强,18C0200耐热能力最弱,其他种质耐热性与初评价结果一致。低温处理下,隶属函数分析得到不同种质苗期耐寒性D值,聚类分析将67个砧用南瓜种质划分为耐寒、中等耐寒和不耐寒3种类型,耐寒能力较强的品种为18C0059、18C0071和18C0203,不耐寒品种为18C0048和18C0117,除18C0059种质外,耐寒重鉴定结果与初步鉴定结果一致。在此基础上,采用逐步回归方法分别建立了建立了砧用南瓜耐盐性的评价方程为D=0.034PH+0.037TS+0.008 FW+0.055DW+0.011Di（R2=1.000,F=3430389.54,p=0.0001）、耐热性的评价方程为D=0.024PH+0.030TS+0.01 1FW+0.030DW+0.048Di（R2=1.000,F=2430078.69,p=0.0001）以及耐寒性的评价方程为 D=0.072PH+0.047TS+0.013FW+0.076DW+0.017Di（R2=1.000,F=4170918.99,p=0.0001）。3.以表型数据（抗逆性）为基础,构建出砧用南瓜初选核心种质。种质分组依据为不同砧用南瓜在高盐、高温以及低温处理下的的抗性水平,取样策略采用优先取样法,设定了 15%、20%、25%、30%、35%五个取样比例,与原始种质进行对比,最终确定了 20%的取样比例为最佳取样比例,构建了砧用南瓜初选核心种质,包含了原始种质的所有表型性状。构建的砧用南瓜初级核心种质包含47份种质,占原始种质的23.15%,初级核心种质对原始种质库的表型保留比例为100%。4.基于SSR分子标记,构建砧用南瓜核心种质。对初选核心种质进行进一步筛选,根据初选核心种质PCR扩增结果,构建0-1矩阵对初选核心种质进行聚类分析,根据聚类结果,从最低层次的分类,优先选取具有优良性状的种质资源入选核心种质,最终得到32份砧用南瓜种质资源构成了砧用南瓜核心种质,占原始种质的15.7%,表型保留比例为70%,对原始种质的代表性较好。