转录因子YY2调控转录的功能和分子机制的初步研究

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转录因子YY2(Yin Yang2)是著名锌指结构域转录因子YY1(Yin Yang 1)的基因在进化中转座产生的一个同源基因,其氨基酸序列上与YY1具有56%的同源性,两者锌指结构域尤为相似,通过与DNA结合兼具对基因转录激活和抑制功能[1]。总所周知,YY]在众多癌症中发挥着重要作用。但是,YY2在癌症发生发展中的生物学功能是如何受到调控的仍不甚清楚。本论文结合全局连续测序技术(global run-on sequencing,GRO-seq)和染色质免疫共沉淀测序技术(chromatin immunoprecipitation sequencing,ChIP-Seq),对转录因子YY2调控的转录事件以及染色质结合位点进行了系统分析,明确了YY2可能参与的生物学功能。为了便于在动物水平对YY2的功能进行研究,本论文进一步构建并杂交获得yy2-/y基因敲除小鼠,为YY2的深入研究提供了实验动物模型。通过分析我们发现YY2的功能以激活转录为主,所以我们着重分析了 YY2激活的基因群,基因功能富集分析显示YY2激活的基因群中最富集功能包括细胞间粘附、姐妹染色单体凝聚、细胞分裂、有丝分裂核分裂等癌症发生发展高度相关的功能,这种激活功能可能与新生RNA的调控机制相关。随后,本课题利用染色质免疫共沉淀偶联高通量测序技术对YY2的染色质上的全基因组结合位点进行了系统分析。我们发现YY2主要结合在启动子附近,与YY2结合的DNA中最富集的序列含有ATGGC序列,与此前报道的YY1结合序列一致[1],这与二者在DNA结合结构域的高度保守性相符合。进一步的整合分析显示,YY2在启动子的结合丰度与其驱动的转录强度相关。综上所述,本论文结合能够精密反映转录事件的全局连续测序技术结合染色质免疫共沉淀测序技术,对转录因子YY2调控的新生RNA和染色质结合位点进行了系统地分析,初步明确了 YY2可能参与的生物学功能及潜在的作用机制。本论文进一步构建并杂交获得yy2-/y基因敲除小鼠,这一重要资源对于深入理解yy2在个体水平的体内功能至关重要。
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