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X染色体是研究表观遗传修饰的模式材料,X异常失活对动物克隆效率是否造成影响,至今仍有争议。本文以来源不同供体核成活克隆牛X染色体作为研究对象,以期发现X表观修饰异常与动物克隆效率有无相关性。
利用亚硫酸氢盐测序法,对胎儿成纤维细胞(FFB)和输卵管上皮细胞(FOV)来源的克隆囊胚及克隆牛Xist基因DNA甲基化进行研究,结果发现,克隆囊胚Xist基因处于较低的DNA甲基化水平,其中FOV来源的克隆囊胚甲基化程度仅为17%;体外受精囊胚DNA甲基化程度为49%。所检测的克隆囊胚Xist基因甲基化程度普遍降低,这说明Xist基因DNA甲基化是可以被重编程的,但在不同供体核之间的重编程也有一定差异,该结果也说明本实验检测的CpG岛可能在调节Xist基因的表达中起作用。胎儿成纤维细胞来源的克隆牛Xist基因DNA甲基化程度相差不大,分别为57%、58%、64%和67%,与自然繁殖牛的耳组织样比较(87%),其DNA甲基化程度均有所降低;相反,以输卵管上皮细胞为供体核的克隆牛,Xist基因DNA甲基化程度相差很大,甲基化程度高的克隆牛达到90%,而1262克隆牛甲基化程度仅为15%,甚至比胚胎期的甲基化程度还低。由于Xist基因是负责调节X失活起始最重要的基因,可能影响到X的失活。克隆牛1262Xist基因的DNA甲基化程度很低,却能正常生长和发育,这说明存活的克隆牛Xist基因DNA甲基化可以是异常的。
利用免疫荧光单染实验,检测不同供体核克隆牛X中期染色体组蛋白修饰的状况。结果发现,早期发育的重编程能够比较完全地消除H3K4m2修饰,克隆牛耳组织能够表现出自然繁殖牛耳组织细胞的H3K4m2标记;H3K9m2修饰比较均匀地散布在整条X染色体上,不同供体核克隆牛仍然带有H3K9m2修饰的细胞记忆;H3K27m3修饰与同源异型基因沉默相关,该修饰在克隆牛中既没表现出自然繁殖牛耳组织的修饰状态,又与供体核细胞的修饰有差异,特别是输卵管上皮细胞来源的克隆牛差异更大,这说明由于受到其细胞原始标记的影响,重编程过程不能很好的消除和添加H3K27m3修饰。上述结果也暗示,即使X染色体表观修饰异常,克隆牛也能安全存活。
免疫荧光双染的实验结果,发现多种组蛋白修饰富集在一起,即在Xp22和Xq23-33附近是耳组织组蛋白修饰集中区域,富集K4m2、K4m3修饰的同时也富集K27m3,同样,K9m2修饰少的X染色体,其它组蛋白修饰如K4m2、K4m3及K27m3也少。免疫荧光染色能够显示整条X染色体组蛋白修饰的分布及强度,但其分辨率很低,不能高分辨地显示基因某一区段的修饰状况,组蛋白修饰的富集只能说明该区段的基因处于活跃的表达调节状态。目前发现去甲基化酶是能够催化一和二甲基化的H3K4去甲基化,这也间接支持重编程能够比较完全地消除H3K4m2修饰的结论。