城市的基因作为人类所创造的各种文化产品和文化容器,与文化传播具备相似的特征,在“基因”的控制下有效推动了城市的快速发展。改革开放推动了中国城市化进程,在城市快速扩张的过程中,一味追求建设速度必然导致现代化生活方式的转变,使古城的可持续发展面临威胁,古城基因保护与城市发展难以统筹协调。因此,城市基因作为城市物质环境与文化的载体,引起各界广泛关注。古城保护开发过程中,在巨大经济利益的驱动下,导致城市建设一味追求速度,使城市特色保护停滞表面。同时,现代化生活方式的转变使得古城特色的可持续发展面临威胁,因此需要从本质上探究古城的特色,才能对古城特色进行有效保护与延续。在此背景下,将生物遗传学中基因的概念运用到古城特色保护的研究中来。基因是一类有效的遗传物质,古城基因是古城特色的内在本质,古城特色是古城基因的外在表现。通过深入分析古城基因的类型及其成因,发掘古城特色的实质。古城基因的传承是一个动态传承的过程,现阶段的古城特色保护虽取得一定成效,但受到不断变化的外在环境的影响,古城基因在传承过程中发生不同程度的变异导致古城基因的传承面临困境。针对古城基因传承面临一系列问题提出古城特色保护的路径,并确立具体的保护策略推动古城基因的传承。从生物遗传学中基因的概念和内涵出发采取文献研究法、综合分析法、调查分析法、逻辑推理法对惠民县孙武古城进行研究,揭示文化、空间基因与城市空间结构更迭之间的对应关系,以此为基础,探索古城发展规律,建立有效的古城保护与更新策略,为持续有效的文化遗产保护提供指导思路。以孙武古城为案例进行各方面内容的解析指出古城基因在传承过程中面临的困境,找到症结所在,对症下药,推进古城的特色保护,在此基础上,探讨出孙武古城的基因保护更新策略。