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研究背景:麻疹是由麻疹病毒(Measles virus,MeV)引起的一种传染性很强的急性发热出疹性疾病。麻疹是一种疫苗可预防的病毒性传染病,通过接种含麻疹成分的疫苗(Measles Containing Vaccine,MCV),可对麻疹产生有效的预防和保护效果。我国大陆麻疹发病在2012年达到历史最低水平,但于2013～2014年麻疹报告发病率大幅回升,2014年成人麻疹病例比例高达42.78%。研究目的:本研究旨在探讨麻疹野病毒主要中和抗原血凝素(Hemagglutinin,HA)核苷酸和氨基酸的遗传变异在2013-2014年麻疹发病复发中扮演的角色,阐明当前我国流行的绝对优势基因型H1麻疹病毒HA蛋白在麻疹发病大幅回升前后的变异规律和趋势,为评价我国疫苗对我国现流行的麻疹野病毒的保护效果提供科学依据。研究方法:本论文选取我国大陆地区2013～2014年流行的H1基因型麻疹野毒株代表株56株,扩增HA基因编码区序列(1854bp)并进行序列测定和分析。从GenBank上下载63株1993～2012年中国流行代表株、中国疫苗株上海191(S-191)和长春47(C-47)以及24株WHO参考株HA基因编码区序列,使用MEGA5.05构建亲缘关系树和进行氨基酸位点比对,使用BioEdit进行同源性关系分析,分析重要中和抗原位点的变异;构建1993～2014年H1基因型HA基因全长编码序列数据集,使用在线分析软件Datamonkey,采用SLAC、FEL、IFEL三种方法对HA基因序列进行正负选择位点的分析。结果:结果显示,H1a作为单一基因亚型麻疹病毒在中国持续传播至少21年,并形成了多个传播链。通过构建基因亲缘性关系树分析,H1a基因亚型可分为3个分支(Lineage),分别为分支 1(Lineage 1)、分支 2(Lineage 2)和分支 3(Lineage 3),其中分支 3 又可分为分支 3a(Lineage3a)和分支 3b(Lineage3b);2013～2014年分离的毒株均位于H1a基因亚型Lineage 3b的两个明显的分支上,将其命名为 Lineage 3b-1 和 Lineage 3b-2。这表明 Lineage 3b-1 和 Lineage 3b-2 是麻疹病毒进化过程中的优势分支。成人病例感染的麻疹病毒与其他年龄段病例感染的病毒在HA基因上并无特征性的差异。56株2013～2014年麻疹病毒代表株HA蛋白编码序列的核苷酸和氨基酸之间的同源性分别为97.80%～99.9%和97.5%～100.0%,与H1基因型WHO参考株(MVi/Hunan.CHN/93/7)核苷酸和氨基酸之间的同源性分别为97.6%～98.1%和96.9%～97.8%,与中国疫苗株S-191核苷酸和氨基酸之间同源性分别为94.3%～94.9%和 94.4%～95.6%。与中国疫苗株S-191氨基酸序列比对,分析我国麻疹野病毒HA蛋白重要氨基酸功能位点的差异,结果显示:2013～2014年麻疹病毒的HA蛋白氨基酸序列第240位上由丝氨酸突变成了天冬酰胺(Ser240Asn),导致了一个潜在的糖基化位点NLS238～240的缺失;7个半胱氨酸残基(分别位于第287、300、381、394、494、579、583位)保持高度保守;与受体CD46结合的位点中,所有的H1基因型麻疹病毒在第481位的酪氨酸(Y)均突变成了天冬氨酸(N),其他潜在的与CD46结合位点除第211、243位发生变异外,均保持稳定;与SLAM受体结合的位点以及新发现的受体nectin-4的结合位点均在进化上保持高度保守;第379～410位是血凝素抗原表位,在第397位发生了氨基酸的替换(Pro397Leu),导致一个潜在的抗原表位的丢失;第236～250位氨基酸被证实是B细胞抗原决定簇,除第240和243位发生了突变外,其他位点均保守。结论:本研究系统分析了 2013～2014年我国大陆流行H1基因型麻疹病毒HA蛋白的核苷酸和氨基酸变异特征,阐明了 2013～2014年麻疹报告发病率大幅回升前后,麻疹病毒HA蛋白重要中和抗原位点未发生重要变异,提示我国使用的麻疹疫苗对我国现流行的H1基因型麻疹病毒具有较好的保护效果。我国应继续加强麻疹病毒血凝素核苷酸和氨基酸的动态监测,为我国消除麻疹提供疫苗使用的科学依据。