山羊高繁殖力候选基因抑制素Alpha亚基基因研究

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为了提高山羊的繁殖性能,增加山羊规模化生产的经济效益,为高繁殖力山羊的标记辅助育种提供基础材料,以江苏省地方山羊品种(黄淮山羊和长江三角洲白山羊)和波尔山羊为试验对象,对抑制素-α亚基(inhibin-α,INHA)基因进行了PCR-SSCP和数量遗传学分析。本研究建立了检测山羊INHA基因的单核苷酸突变的PCR-SSCP方法,并且分析了三个山羊群体INHA基因的遗传变异。采用PCR-SSCP技术检测INHA基因启动子区、5调控区和外显子1在高繁殖力山羊品种(黄淮山羊和长江三角洲白山羊)以及低繁殖力山羊品种(波尔山羊)中的单核苷酸多态性,同时研究INHA基因对黄淮山羊高繁殖力的影响。研究结果发现:黄淮山羊、长江三角洲白山羊和波尔山羊在INHA基因5’调控区引物2位点检测到3种基因型,测序发现发生了两处碱基突变(260T→G和353A缺失);黄淮山羊、长江三角洲白山羊和波尔山羊AA基因型频率分别为0:8434、0.8421、0.9167,AB基因型频率分别为0.1084、0.1053、0.0278,BB基因型频率分别为0.0482、0.0526、0.0556;基因型与产羔数相关分析发现突变纯合型(BB)和突变杂合型(AB)的黄淮山羊平均产羔数分别比野生型(AA)多1.25只(P<0.01)和0.78只(P<0.05)。三个群体在该位点的基因型分布极显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01),说明该位点有经过人工选择的可能。在INHA基因外显子1引物4位点也检测到3种基因型,测序发现发生了1处碱基突变(1006C→A),该突变导致编码氨基酸由脯氨酸改变为苏氨酸;突变在三个山羊群体中都检测到;黄淮山羊、长江三角洲白山羊和波尔山羊CC基因型频率分别为0.3214、0.4444、0.5526,CD基因型频率分别为0.3929、0.4167、0.3421,DD基因型频率分别为0.2857、0.1389、0.1053;基因型与产羔数相关分析发现突变纯合型(DD)和突变杂合型(CD)黄淮山羊平均产羔数分别比野生型(CC)少0.65只(P<0.05)和0.41只(P>0.05)。该位点在黄淮山羊群体基因型分布显著偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05),而长江三角洲白山羊和波尔山羊的基因型分布处于平衡状态(P>0.05)。黄淮山羊、长江三角洲白山羊和波尔山羊在引物2位点的多态信息含量(PIC)分别是0.1669、0.1706、0.1209,属于低度多态位点;在引物4位点分别是0.3747、0.3506、0.3200,属于中度多态位点。本研究结果初步表明INHA基因可能是影响黄淮山羊高繁殖力的一个主效基因或是与之存在紧密遗传连锁的一个分子标记。
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