国防科研院所员工的绩效考核和薪酬体系研究是一个比较复杂的过程，原因在于国防科研活动具有非确定性、风险性、长期性及团队合作性等特点，人员的工作业绩难以量化，再加上计划经济时期长期形成的人事管理制度的影响，国防科研院所缺乏有针对性的、科学的、合理的绩效考核和薪酬体系，导致近年来国防科研院所人才流失率较高。因此，建立高信度与高效度的科研人员绩效考核与薪酬体系，最大限度地提高员工满意度，激发员工的工作积极性，降低组织的人力资源成本，是国防科研院所人力资源管理所关注的问题。本文以QD研究院员工绩效考核和薪酬体系实务为背景，综合运用了现代人力资源管理理论和方法，分析了各种绩效考核方法的优缺点和适用范围，提出了绩效考核指标体系的建立应当遵循科学性原则、实用性原则、可操作性原则、导向性原则。论述了薪酬体系的构成和功能，提出了薪酬体系设计应当遵循公平性、经济性、战略导向、倾斜性、绩效分配及以岗位评价为基础的原则。论文以人力资源管理研究较少涉及的国防基础性科研院所为研究对象，在运用绩效考核理论和薪酬管理理论的基础上，将二者有机结合，构建了一个与薪酬紧密相关、相对完整的绩效考核体系，并针对新型绩效考核体系与薪酬方案实施过程中可能遇到的问题，提出了实施保证与解决对策。