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研究背景:缺血缺氧的微环境是大多数肿瘤形成和演进过程中普遍存在的现象,HIF-1是细胞应激缺氧时所产生的转录激活因子,可直接或间接调节100余种靶基因的转录激活,结果使肿瘤细胞能够适应缺氧微环境,并保持不断增殖、浸润和转移的能力。蛋白质组学可以规模化地同时发现或找出多个与肿瘤发生发展相关的蛋白质或蛋白质组群,对其进行定性、定量分析,从整体网络水平了解细胞内信号转导通路,揭示肿瘤发病机制。
目的:分析人乳腺癌细胞MDA-MB-231细胞系和经HIF-lαsiRNA干扰后的MDA-MB-231细胞株之间差异表达蛋白质,探讨在肿瘤生长过程HIF-1的作用及参与的靶蛋白。
方法:联合采用RNA干扰技术和蛋白质组学研究方法,建立MDA-MB-231细胞系和经HIF-1αsiRNA干扰后的MDA-MB-231细胞株的差异表达蛋白质图谱,经双向凝胶电泳后切取差异倍数在两倍以上的蛋白质点,由北京华大蛋白质组学研发中心协助质谱分析。采用Western Blot验证其中部分差异蛋白质。
结果:经质谱分析得到21种蛋白质,包括能量代谢相关酶,抗氧化剂,增殖侵袭转移相关蛋白,细胞骨架相关蛋白,涉及核酸生成、转录和翻译相关蛋白质等几类。其中大部分蛋白质为经RNA干扰后表达下调,部分是HIF-1的已知靶蛋白,部分可能与HIF-1有间接关系。对差异蛋白质的检测结果与比较蛋白质组学研究的结果部分一致。
结论:本研究经HIF-1αsiRNA干扰后鉴定出21个差异表达蛋白质,功能涉及到肿瘤恶性生物学进展的多个环节。