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林麝是当今世界现存五种麝中的一种,它主要分布在中国西南部及其临近地区。在中国,超过半数的林麝分布在四川省,是重要的资源动物。
目前仅有少量的林麝微卫星座位被筛选出来,这对于林麝遗传多样性研究是不够的。在本次研究中,通过PCR优化以及借用近缘物种具有多态性的微卫星位点两种方法从林麝基因组中筛选新的微卫星位点。共有13个新位点被筛选出来,其中通过PCR优化获得的5个座位具有高度的多态性。用这5个座位对都江堰金凤山和马尔康养殖场的圈养林麝做遗传多样性分析。在金凤山和马尔康圈养林麝群体中,这5个座位等位基因数量为4~13个,平均每个座位在金凤山居群中为8.8个,马尔康居群中为6.8个;5个微卫星座位在金凤山居群中有效等位基因数在2.341~8.605之间,而马尔康居群有效等位基因数在3.328~9.020之间,而有效等位基因数在两个居群中的平均值分别为4.979和4.830;金凤山居群表观杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0.429~0.957和0.587-~0.902。马尔康居群表观杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0.391~0.913和0.716~0.920。5个微卫星座位的多态信息含量(PIC)最低为0.519,最高为0.891,表明金凤山和马尔康圈养林麝群体具有较高的遗传多样性。