大黄鱼（Larimichthys crocea）是江苏沿海最重要的海洋经济捕捞鱼类之一,在我国黄海南部、东海和南海都有广泛分布。20世纪70年代之前江苏吕四渔场的大黄鱼自然资源丰富,但是由于过度捕捞和栖息地环境恶化等原因导致大黄鱼自然资源量逐渐下降和衰竭,为了解决大黄鱼自然资源不足的问题,江苏省开展了迄今为止数十年的大黄鱼苗种增殖放流活动,但大黄鱼仍被认定为黄海区资源衰退种类。因此对大黄鱼增殖放流效果开展科学、量化评估,制定科学的放流策略,保持大黄鱼的种质资源的有效性研究就显得尤为重要,本研究以期为大黄鱼的资源恢复和渔业资源的可持续发展提供科学的基础。本文基于江苏近岸海域渔业资源底拖网调查,结合大黄鱼耳石指纹标志、分子标记和社会调查结果进行分析,探究了大黄鱼自然资源变化、锶元素指纹标记和分子标记对野生大黄鱼和放流个体的判别,主要研究结果如下:基于2016-2020年江苏近岸海域渔业资源底拖网调查资料,分析了江苏近岸海域渔业种类、资源量、优势度和多样性水平的时空变化以及对比捕获到大黄鱼的站位资源量和多样性水平。2016-2020年共计捕获渔业种类176种,其中鱼类97种,甲壳类共计存在51种,头足类共计存在7种,其他类共计存在2种。整体上来看,除2019年平均资源量较高外,其余年份平均资源量相差较小,鱼类年平均资源量呈下降趋势,甲壳类相比呈上升趋势,头足类相差较小。2016-2020年间季节资源量比较,夏季平均最高,依次为秋季、春季。江苏近岸海域渔业资源调查站位平均Shannon-Wiener多样性指数H’为2.51,D指数平均为1.96,J’指数平均为0.59;江苏近岸海域渔业资源种类优势种（IRI≥1000）有6渔业资源种类,分别是口虾蛄、三疣梭子蟹、龙头鱼、棘头梅童鱼、鮸以及小黄鱼。2016-2020年江苏近岸海域渔业资源调查共有10个站位捕获到大黄鱼,捕获站位多样性水平均低于该月渔业资源调查平均多样性水平,但资源量和资源密度均高于平均水平。潮间带调查综合分析了大黄鱼中放流海域中的索饵与分布的关系;社会调查中,9月平均捕获量最多,形成了一定的渔汛。综上说明增殖放流大黄鱼对提高自然群体资源量和捕捞产量起到了良好的生态效益和经济效益。基于2019年江苏省放流前的大黄鱼标记苗种以及400尾回收大黄鱼的耳石元素标记检测结果,分析了大黄鱼增殖放流标记苗种的标记情况和在自然海域大黄鱼的标记保存以及适用性,通过对放流标记苗种与对照组苗种进行ICP-MS检测,结果显示,经18mg/L浓度锶离子处理的大黄鱼苗种在距离耳石核心0.60~0.80mm处形成了明显的锶元素指纹标记,对照组苗种在0.60~0.80mm处并不存在锶元素指纹标志,随机抽取的标记苗种都出现了明显的标记,标记的成功率为100%;2019年江苏全省放流大黄鱼4158.16万尾,其中标记鱼37.72万尾,占比0.91%;2019-2020年在吕四、如东和海门等地海上调查回捕和社会调查中回收的400尾大黄鱼中有8尾在距离耳石核心0.40~0.80mm处存在Sr/Ca比值波峰,可以认定为大黄鱼标记鱼,占回收样品总数的2.0%,高于2019年增殖放流大黄鱼标记鱼所占比例;对这8尾标记大黄鱼进行耳石年龄鉴定,其中1龄和2龄个体各3尾,3龄个体2尾,各年龄层次的大黄鱼标记鱼和高于标记放流苗种的比列可说明大黄鱼的增殖放流活动对自然种群具有持续的补充作用,锶元素耳石指纹标记可作为江苏省大黄鱼增殖放流效果评估的依据之一。基于对放流前82尾大黄鱼苗种和116尾回收的大黄鱼样品进行亲缘鉴定的结果,分析分子标记技术在江苏省大黄鱼增殖放流效果评估中的适用性和除增殖放流中标记大黄鱼苗种外的其他放流苗种的判别,结果显示,大黄鱼回收群体和放流苗种群体的线粒体DNA单倍型数量分别为106和31,多态位点数量分别为141和75,单倍型多样度为0.9984±0.0014和0.8735±0.0308,核苷酸多样度分别为0.0217±0.0108和0.0141±0.0072,82尾大黄鱼放流苗种和116尾回收大黄鱼共定义133个单倍型,其中34尾放流苗种与5尾回捕大黄鱼共享4个单倍型,可能为放流的大黄鱼,对未排除的大黄鱼样品使用微卫星分子标记进一步判别。筛选出来的3个多态性较高的大黄鱼微卫星位点一共检测出等位基因78个,其观测杂合度计算得1,期望杂合度在0.9038~0.9387之间（平均值为0.927）,多态性信息含量为0.8834~0.9222（平均值为0.909）,线粒体DNA标记未排除的34尾放流苗种和5尾回收大黄鱼中有33尾放流苗种不存在有相同等位基因的回捕大黄鱼,和本次回捕的大黄鱼没有亲缘关系,被排除;3尾回捕大黄鱼不存在有相同等位基因的放流苗种,被排除,剩余回收大黄鱼可以找到与之有亲缘关系的放流苗种,这2尾回捕大黄鱼和1尾放流苗种在3个微卫星位点的等位基因相同,可判定这2尾回捕大黄鱼为放流大黄鱼。2019-2020年在吕四和如东等地海上调查和社会调查中回收的116条大黄鱼中,检测出2尾与放流苗种存在亲缘关系的个体,占回捕样品总数的1.72%。分子标记技术可成为判定未标记大黄鱼的方法,补充锶元素耳石指纹标记技术,使得大黄鱼增殖放流效果评估更加的科学和可信。