SMAD3甲基化及miR-548h水平改变在动脉粥样硬化性心血管疾病诊断中的价值研究

来源 :南京大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:blueskyxq
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
研究背景:动脉粥样硬化(atherosclerosis,As)性心血管疾病(cardiovascular disease,CVD)已成为威胁人类健康的主要原因,As作为CVD最主要的病理基础,其发病机制目前尚未完全阐明,亦缺乏能够有效反映As病理改变的血液学标志物。血脂异常是As公认的独立危险因素,其中氧化低密度脂蛋白(oxidized low density lipoprotein,ox-LDL)起着关键作用。研究显示,ox-LDL可刺激As相关细胞DNA甲基化和微小核糖核酸(micro RNA,mi RNA)的表达发生变化,诱导细胞功能改变,参与As的发生、发展。越来越多证据表明,As可受表观遗传学调控,其中DNA甲基化和mi RNA所引起的基因表达调控作为表观遗传中重要的两大调节过程,二者可相互调节并在As性CVD发生发展过程中发挥重要作用。因此,探寻As性CVD中的DNA甲基化和关键mi RNA及其相互作用机制,可为As新型生物标志物研发及揭示As的病理分子机制提供新思路和理论依据。研究目的:通过研究As性CVD患者特定基因甲基化程度改变、相关mi RNA的水平变化,探究外周血特定基因DNA甲基化相关mi RNA作为As性CVD潜在检测指标的临床价值,进一步通过构建ox-LDL刺激As相关细胞模型,初步揭示二者共同参与As发生发展过程中的潜在分子机制。研究方法:(1)从课题组前期DNA甲基化芯片结果中挑选As性CVD患者甲基化程度显著改变的SMAD3基因,生物信息学方法预测与其共启动子表达的mi RNA(mi R-548h)。收集确诊为As性CVD的患者80例,包括急性冠脉综合征(acute coronary syndrome,ACS)患者42例、稳定性冠心病(stable coronary artery disease,SCAD)患者38例,以及同期在本院健康体检中心进行体检的健康对照者30例。采用全自动生化分析仪检测患者血脂指标和血生化指标;采用甲基化特异性PCR(methylmion specific PCR,MSP)和实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,RT-q PCR)分别检测患者及对照外周血SMAD3基因甲基化水平和外周血mi R-548h水平;利用ROC曲线分析、单因素及多因素Logistic回归分析等多种统计学方法,评估两者单独或联合检测对As性CVD的诊断价值。(2)EA.Hy926人脐静脉内皮细胞融合细胞在体外铺板预培养24 h后,加入终浓度为100μg/m L的ox-LDL,建立不同时间点的内皮细胞损伤模型。运用MSP、RT-q PCR技术分别检测SMAD3启动子区域67356838、67356942两位点的甲基化修饰程度及mi R-548h水平;通过亚硫酸氢盐测序法(bisulfite sequencing PCR,BSP)进一步确认SMAD3的甲基化程度;在EA细胞中瞬时转染mi R-548h mimics和mi R-548h inhibitor,q RT-PCR检测转染效果;蛋白免疫印迹(Western blot,WB)检测mi R-548h预测靶基因蛋白的表达水平。结果:(1)与健康对照相比,ACS及SCAD患者外周血SMAD3基因启动子区域67356838(位点1)、67356942(位点2)两位点的甲基化程度及平均甲基化程度均显著降低,而外周血mi R-548h水平显著升高(P均<0.05);相关性分析显示,循环mi R-548h水平与SMAD3位点1、2甲基化程度及平均甲基化程度均显著负相关(P均<0.05);SMAD3甲基化改变对于ACS及SCAD患者诊断的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.856和0.680,mi R-548h水平改变对于ACS及SCAD患者诊断的AUC分别为0.994和0.918,二者联合诊断的AUC分别为0.996和0.970。采用配对设计两种诊断试验AUC差别假设检验进行比较结果显示:联合SMAD3/mi R-548h Panel判别全部CVD的AUC效能显著高于单独检测SMAD3甲基化(Z=4.293,P<0.001)或mi R-548h水平的AUC(Z=2.158,P<0.05);联合SMAD3/mi R-548h Panel分别判别SCAD(Z=3.645,P<0.001)和ACS(Z=2.947,P<0.05)患者的AUC效能显著高于单独检测SMAD3甲基化的AUC效能。(2)经ox-LDL处理的EA细胞损伤模型中,SMAD3甲基化程度显著下降,mi R-548h水平显著升高;生物信息学分析预测发现血管生成素2(angiopoietin 2,ANGPT2)和过氧化物酶体增殖物激活受体γ(peroxisome proliferator-activated receptorγ,PPARγ)是mi R-548h的潜在靶基因;Western blot结果显示,在体外人为过表达或抑制mi R-548h水平,可明显影响ANGPT2、PPARγ蛋白表达水平。结论:As性CVD患者外周血SMAD3甲基化水平显著降低,而其共启动子表达的mi R-548h水平显著升高,是As性CVD患者潜在的诊断指标,两者联合检测有望成为一种新的As性CVD诊断新指标和新方法;SMAD3甲基化水平降低与mi R-548h表达上调具有一定相关性,后者可能调控ANGPT2、PPARγ蛋白表达参与As相关内皮细胞损伤,与As性CVD发生发展密切相关。
其他文献
改革开放以来,我国粮食生产取得了重大成就,但农业污染和生态环境破坏等问题也愈演愈烈。当前环境资源趋紧问题对农业生产的制约性正逐渐加强,推动农业绿色化发展,破解资源环境压力,对实现我国农业可持续发展具有重要的现实意义。传统农业生产效率的测算忽略了农业生产造成的污染问题,无法充分体现出农业可持续发展的能力,农业环境技术效率将环境污染作为农业生产的一种非期望产出纳入到传统的生产率分析框架中,可以有效地衡
糖尿病是影响人类健康的常见疾病之一,其危害性大,防治效果差,备受人们关注。近年来,比化合药物具有更多优势的食源性降血糖生物活性肽被开发利用,显示出广泛的应用前景。驼乳作为一种绿色无公害的天然乳源,其营养成分独特,容易消化吸收,营养价值远高于其他动物乳。其中的蛋白质含量和种类十分丰富,还含有特殊的生物活性成分等,在防治糖尿病方面表现的格外突出。因此,本论文旨在利用木瓜蛋白酶、风味蛋白酶、复合蛋白酶和
2020年中央一号文件提出,要构建“银保担”风险共担的普惠金融服务体系。农业信贷及农业保险是确保我国农村金融普惠体系完善建立的重要政策,是保卫我国脱贫攻坚战胜利果实的重要抓手。对于农民来说,实现脱贫仅仅是奔赴小康的第一步,而如何增收致富、全面建设小康才是农村发展中的现实问题。农业信贷能发挥“造血”功能,支持农户扩大生产规模,而农业保险能防范重大风险,是国际认可的农业风险管理工具。因此,研究二者联动
随着人工智能技术的革新、硬件技术的发展以及三维扫描技术的成熟,3D计算机视觉逐渐成为一个热门的研究方向。点云是3D计算机视觉中最常用的一种数据类型,其包含丰富的语义信息,具有海量、高精度和高密度等特性。点云已被广泛应用于自动驾驶、机器人感知、三维场景重构、AR/VR以及遥感测绘等众多领域。近年来,随着深度学习技术的兴起,基于深度学习的三维点云感知受到研究者们广泛关注,深度学习算法无论是在精度上还是
扑翼微型飞行器是一种以昆虫和鸟类等生物为仿生模板的创新型飞行器,其仿生化程度更高,集举升、悬停和推进等功能于一个扑动系统中,具有体积小、隐蔽性强、飞行灵活度更高、噪音更低等优点,在军事和民用领域具有广泛的应用价值和良好的发展前景。现有的扑翼微型飞行器与飞行类生物相比无论是在空气声学特性还是空气动力学特性方面都没有达到理想的水平,因此,本文将通过仿生学的原理以及飞行生物的尺度律原则设计出一种以蜻蜓翅
儿童是需要被社会关怀和保护的“弱势群体”,住区作为与儿童关系最为密切的场所,是儿童在整个童年时期开展交往、游戏等活动的重要载体,儿童在这些经历中逐步习得并提高认知能力、社交能力以及思维能力,为未来完整的、健全的人格的形成打下良好的基础。因此,营造一个能够满足儿童需求,吸引儿童走出家门,参与户外活动的住区空间环境对儿童的成长发展来说至关重要。本文首先系统阐述了儿童友好城市理论的发展历程、定义内涵以及
目标跟踪是计算机视觉领域的一个重要分支,广泛应用于自动驾驶、视频监控、智能交通和人机交互等领域。给定目标在视频序列中初始帧的位置和大小,目标跟踪通过对目标外观和运动状态建模以预测出目标在后续帧中的位置和大小。近年来随着深度学习的不断发展,基于深度学习的目标跟踪算法的性能开始超过传统的目标跟踪算法,其中基于孪生网络的目标跟踪算法因兼顾准确率和速度成为目前最主流且效果最好的跟踪算法之一。然而实际场景中
在风力发电初期,风电场并网后容易因电网电压故障造成严重的脱网事故。针对此现象,应用了低电压穿越技术,大大改善了风电场并网能力,但低电压穿越技术的研究对象主要以单台风机为主,关于风电场的研究甚少,因此使得一些技术并不能让风电场完全满足低电压穿越的技术标准,需要从其他方面考虑提高系统的并网性能。另外因对称故障下的电压跌落情况最严重,所以本文研究了电网电压对称故障下集电线路阻抗对低电压穿越性能的影响。为
书院是我国封建社会传播传统文化的重要场所,体现了历代统治者和文人墨客对于儒学、理学等思想学说的认可、推崇及褒扬。它物化地呈现出不同历史时期政治、经济、文化发展的情况,是物质和精神财富的复合载体。随着朝代的更替,书院的主要职能略有差异:唐代初诞生时以藏书为主;宋元时期主要是集会和讲学,兼具藏书与祭祀功能;明清则以讲学和科举并重。浙江是书院大省,历来书院的建设数量位居全国前列。明清之际,浙江的书院林立
现今,配电网是电力系统的重要组成部分,也是耗资巨大的一部分,因而对其重构是节省成本的重要一环。通过改变配电网络的拓扑结构来提高供电的可靠性和电能质量并降低网络损耗,对改善社会经济效益具有重大意义。分布式电源(DG)是一种能更好的代替传统供电的新能源,当DG并网时,对配网的控制方式、整定保护等有巨大影响,对其研究具有重要的理论意义和实用价值。首先,选择当今运用广泛的量子粒子群算法来进行配电网重构,着