大白菜遗传图谱构建及抗TuMV的QTL分析

来源 :山东农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhengwei129
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本研究以大白菜高抗TuMV白心株系91- 112和高感TuMV桔红心株系T12-19为亲本建立的100个小孢子培养DH系作为图谱构建群体,构建了AFLPs、RAPDs和SSRs分子标记连锁遗传图谱,并在此基础上进行了大白菜TuMV抗性基因的QTL定位。主要研究结果如下:⑴ 对不同标记用于遗传图谱构建的效率进行了评价。从64对AFLP引物组合中筛选出20对扩增清晰、再现性好的多态性引物,平均每对AFLP引物组合扩增出13.2个多态性谱带;SSR从15个引物对中筛选出6对多态性引物,产生17个多态性谱带,平均每个引物对扩增出2.8条多态性谱带;RAPD中从500个随机引物中筛选出99个多态性引物,共扩增出150个多态性位点,平均每个引物产生1.5条多态性带。由此可以判断,多态性检出效率为AFLP>SSR>RAPD。⑵ 对263个AFLP标记,150个RAPD标记和17个SSR标记共430个标记用JoinMap 3.0软件进行分析,得到一张包含376个标记10个连锁群的遗传图谱,图谱总长度为809.1cM(235个AFLP标记,129个RAPD标记,10个SSR标记,1个SCAR标记和1个桔红心形态标记),标记间平均图距为2.2cM。每个连锁群上的标记数在7~91之间,长度位于26.4~145.9cM 之间。⑶ 对DH群体标记的来源进行了分析。用于构建图谱的235个AFLP标记中,来自91-112的标记较多,有144个,占61.3%;来自T12-19的标记有91个,占38.7%。10个SSR标记中,来自91-112的标记有6个,占60%,来自T12-19的标记占40%,可见SSR产生的标记也是主要来自91-112。而在RAPD扩增中,来自91-112和T12-19的标记分别为65个和64个,比例相当。但整体看来,在连锁群的376个标记中,来自91-112的标记215个,占57.2%,来自T12-19的标记160个,占42.8%,两者比例基本持平。<WP=7>⑷ DH群体中不同的标记产生的偏分离比例也不相同。所构建的10个连锁群中,共产生149个偏分离标记,占39.8%,其中在0.01水平上的偏分离标记占25.9%,在0.05水平上的占13.9%。AFLP共产生97个偏分离标记,占所有AFLP标记总数的42.2%。其中偏向91-112的有52个,占53.6%,偏向T12-19的有45个,占46.4%,有偏向91-112的趋势。SSR产生的标记中有29.4%的偏分离比例,偏向91-112的占40%。RAPD共产生47个偏分离标记,占标记总数的33.3%,其中偏向91-112的有18个,占38.3%。由此可见,RAPD和SSR产生的偏分离标记主要偏向T12-19。从整体来看,3种标记产生的149个偏分离标记中,偏向91-112的有72个,偏向T12-19的有77个,分别占48.3%和51.7%,基本持平。⑸ 利用JoinMap3.0软件和区间作图法分析,共检测到4个抗北京TuMV-C4株系的QTLs位点。其中2个QTLs与白菜苗期抗性(人工接种鉴定)有关,命名为Tu1和Tu2。一个位于连锁群LG5a上,能解释表型变异的61.0%,当Tu1表现亲本91-112(高抗TuMV)的基因型时,具有降低病情指数10.61%的加性效应。另一个位于LG9上,能解释表型变异的14.7%,当Tu2表现亲本T12-19基因型时,具有增加病情指数5.22%的加性效应。表明除该2个QTLs位点外,可能还有许多效应值较小的QTLs没有检测到。田间成株期自然接种鉴定时检测到了另外的2个QTLs位点,一个位于LG3上,命名为Tu3,能解释表型变异的48.5%,当它表现亲本91-112的基因型时,能导致病情指数降低26.33%。另一个位于LG4上,命名为Tu4,能解释表型变异的32.0%,当它表现亲本T12-19的基因型时,能使病情指数增加17.27%。所以推断大白菜TuMV-C4抗性为不完全显性,至少受3对以上显性基因的控制,支持数量性状基因控制TuMV抗性的观点。该结果为开展大白菜TuMV抗性分子标记辅助选择提供理论依据。
其他文献
辣椒的杂种优势明显,利用细胞质雄性不育(CMS)三系配套制种是辣椒杂种优势利用的重要途径。有关辣椒细胞质雄性不育基础理论的研究薄弱,远远落后于玉米,水稻等作物的雄性不育机理
面对新形势,中国石化物资供应战线将持续探索管理创新、机制创新、模式创新、平台创新、工具创新,建设数字化支撑、网络化共享、智能化协作、国际化发展的新时代电商平台.同
期刊
森林草莓(Fragaria vesca),又名野草莓,是野生二倍体种(2n=2x=14),其基因组很小,只有约240 MB,生长周期短、容易再生,为研究草莓基因组提供了的巨大的优势,是草莓育种和研究
先期抽薹问题已成为春大白菜栽培及高原高寒冷凉地区夏秋大白菜生产发展的瓶颈。本文从晚抽薹大白菜(YH)、小白菜(FMS、WS)及芜菁(MM)的生理生化特性、遗传效应及分子标记入
为了解决具有100%不育株率的大白菜核基因雄性不育系转育和利用难的问题,以核不育“复等位基因遗传假说”为理论依据,用已知基因型的核基因雄性不育材料为不育源,设计“合成转育
本试验以榨菜为试验材料,比较了SA处理对TuMV感染的榨菜生长、光合作用、叶绿素荧光参数、抗氧化酶活性等的变化。研究了榨菜不育系植株在不同温度条件下光合作用的变化。结