飞鸟是如何聚集成群的? 蚂蚁如何形成王国? 为什么冷战结束，世界反而硝烟四起? 为什么苏联以及东欧等一系列社会主义国家会在1989年的几个月内轰然坍塌? 生命是如何起源的? 计算机病毒具有生命么? 为什么在1998年爆发了亚洲经济风暴，进而导致全球的经济危机? 大脑是什么?难道大脑仅仅是简单的随机进化的结果么? 感情、思想、目的和意识这样不可言喻的特征是如何产生的? 这些问题看似不是什么科学的问题，然而它们都有一个共同点，就是都属复杂系统。 著名英国理论物理学家霍金，2000年曾说过一句名言：”我认为，下个世纪将是复杂性的世纪”。这句话高度概括了下个世纪理论科学面临的任务是处理各种复杂系统，也就是我们要建立一套不同于过去的理论体系以面对二十一世纪的科学挑战。 本人自2004年6月份进站以后，主要围绕着复杂系统及其在社会经济系统中应用方面进行了相关研究。 本报告分六章对本人在博士后期间的研究工作进行了汇总。 第一章从系统科学的角度，讲述了系统科学的发展历程以及复杂性科学的兴起； 第二章讨论了复杂网络作为现时研究复杂系统的重要工具，它的特点，发展； 第三章主要讨论了复杂网络的生长模型，并根据实际生物系统的特点，提出了新的节点复制生长模型，更好的解释了实际系统的演化过程； 第四章主要分析了复杂网络的结构，讨论了群体的定义及其辨识方法，并提出了新的算法，该算法计算复杂度小，且又很好的实际分析效果； 第五章研究复杂系统的演化过程，扩散在物理，生物，社会经济系统中都引人关注，本章论述主要的扩散模型，并提出了扩散过程的优化算法； 第六章从混沌理论谈起，以一类金融模型为例，研究了复杂系统的控制同步，即希望通过对于复杂系统模型的研究，指导现实系统的调控。 通过博士后工作，一方面，综合探讨了复杂系统，对结构，生长，演化和控制管理有了比较深入的认识。另一方面，结合实际社会经济系统，对如何应用理论，指导实际管理有了切实的认识。