基于表达谱数据构建并验证前列腺癌患者根治术后复发风险预测模型

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研究目的:若能实现对接受根治性手术治疗后前列腺癌(prostate cancer,PCa)患者的无复发生存(recurrence-free survival,RFS)情况实时监测,对于患者术后治疗策略制定、临床研究开展、随访计划调整等意义重大。当前研究旨在基于公共数据库中的基因表达谱数据,建立并验证一项RFS预后预测模型。研究方法:研究共纳入5项独立队列,包含1,046例含有RFS预后信息的表达谱数据。利用单因素分析,在5项队列研究中分别计算与RFS相关的候选基因,取交集。并利用多因素Cox回归分析计算出每个候选基因的相对应的系数(co-efficient,co-ef),联合候选基因表达数据构建RFS预后预测模型。研究采用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)及曲线下面积(area under the curve,AUC)来评估模型的预测价值。此外,利用Pearson相关分析可得出与候选基因共表达的基因集合,利用KEGG信息数据库(kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集分析来探究这些关键候选基因影响PCa进展的潜在机制。最后,我们对比了这些关键候选基因在不同临床亚组间的表达差异,如复发与否、不同年龄分层、肿瘤等级等。研究结果:针对五项独立队列数据的单因素Cox回归分析结果取交集,共鉴定出7个与RFS预后显著相关的共识基因(P<0.01)。并利用多因素Cox回归分析提供的co-ef和候选基因的表达数据,构建PCa患者RFS预后预测模型。Kaplan-Meier(K-M)分析结果提示,在所有队列中,经RFS预后预测模型鉴定为低危的患者大多比高危患者预后好。AUC值证实了该模型具有优异的预测效能。此外,研究还在公共数据库和本中心临床样本中,分析了这7个候选基因表达与临床病理特征的关联,利用共表达分析和KEGG通路富集分析预测了关键候选基因影响PCa进展或预后的潜在机制。研究结论:当前研究基于公共数据库数据和本中心样本资源,构建并成功验证了一项RFS预后预测模型,并揭示了关键基因影响PCa进展或预后的潜在机制,为推进前列腺癌患者个体化医疗提供理论依据。
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