现阶段研究中能影响DNA条形码鉴定的主要因素有cox1片段的进化速率差异、地域差异、胞内共生菌Wolbachia、线粒体假基因-Numts和线粒体异质性。本研究选用了15种常见的节肢动物,每个物种选用的个体数都超过了5头以上,并且每个物种的个体都来自于同一个种群,以此研究种群内DNA条形码的差异,以及DNA条形码是否可以很好的鉴定物种,是否会因差异过大而出现隐存种的假象造成生物种类的高估。经过研究可以得出以下结论:一、15个物种中,黄粉虫(Tenebrio molitor)和普通卷甲虫(Armadillidium vulgare)物种内的DNA条形码差异超过了2%,种间最大遗传距离分别可达4.0%与6.2%,可能影响DNA条形码的准确性,这两个物种占所有物种数的13.3%。二、黄粉虫种群内差异可以排除胞内共生菌Wolbachia感染和Numts的影响,但同一母本的不同子代之间却没有差异。三、普通卷甲虫种群内差异是由于线粒体异质性引起的,在同一个个体内可检测到两种单体型的存在,同时该虫的同一母本不同子代之间也有~6%的差异。通过qPCR的方法得到Sanger测序所得序列仅来自于含量较高的单体型,而未反映出低频次单体型的存在。四、黄粉虫在线粒体的其他基因上也表现出有不同程度的差异,但整个线粒体基因组差异小于条形码序列的差异。