本文根据2012年至2014年期间采自三门湾和乐清湾两个典型的浙江中南部沿岸海湾的浮游植物样品，分析了浙江中南部典型海湾浮游植物的物种多样性、丰度、分布和多样性指数及其与环境因子的关系，探讨区域分域与浮游植物多样性的关系。主要结果如下:　　1、在两个海湾共记录浙江沿岸港湾浮游植物144种，其中出现于三门湾的有109种，变化规律为夏季（73种）＞春季（65种）＞冬季(44种)＞秋季(39种);出现于乐清湾的有87种，变化规律为夏季（56种）＞春季（51种）＞冬季（45种）＞秋季（41种）。　　2、三门湾的主要优势种有琼氏圆筛藻（Coscinodiscus jonesianus）、虹彩圆筛藻（Coscinodiscus oculus-iridis）、中肋骨条藻（Skeletonema costatum）、中国盒形藻（Biddulphia sinensis）、蛇目圆筛藻(Coscinodiscus argus)、杂球藻（Pleodorina californica）、尖刺伪菱形藻（Pseudo-nitzschia pungens）、针杆藻(Synedra spp.)等，其中琼氏圆筛藻为四季共有优势种，虹彩圆筛藻为春秋冬三季共有优势种，中肋骨条藻为夏秋两季共有优势种，蛇目圆筛藻和针杆藻为秋冬两季共有优势种。　　乐清湾的主要优势种有琼氏圆筛藻（Coscinodiscus jonesianus）、虹彩圆筛藻（Coscinodiscus oculus-iridis）、布氏双尾藻（Ditylum brightwellii）、钝头菱形藻（Nitzschia obtusa）、中肋骨条藻（Skeletonema costatum）、夜光藻（Noctilucascintillans）等，其中琼氏圆筛藻为四季共有优势种，虹彩圆筛藻和钝头菱形藻为春秋冬三季共有优势种，中肋骨条藻为夏秋冬三季共有优势种，布氏双尾藻为春夏两季共有优势种。　　3、三门湾浮游植物总平均丰度为1085.40×103个/m3，变化趋势为:夏季（3724.45×103个/m3）＞春季（289.70×103个/m3）＞冬季（143.09×103个/m3）＞秋季（94.49×103个/m3），最低丰度在20号站，最高丰度在16号站。　　乐清湾浮游植物总平均丰度为1457.48×103个/m3，变化趋势为:夏季(5099×103个/m3)＞春季(257.78×103个/m3)＞秋季(230.49×103个/m3)＞冬季(242.64×103个/m3)，最低丰度在21号站，最高丰度在2号站。　　4、三门湾的物种多样性(H)变化规律为冬季(2.36)＞春季(2.11)＞秋季(2.01)＞夏季(1.90)。　　乐清湾的物种多样性(H)变化规律为春季(2.09)＞夏季(1.81)＞冬季(1.56)＞秋季(1.52)。三门湾的物种多样性比乐清湾要好。　　5、本文对三门湾及乐清湾海域的游植物群落与环境因子进行主成分分析(PCA)，分析结果表明浮游植物的分布受悬浮物、硝酸盐(NO3--N)和亚硝酸盐(NO2--N)等环境因子的影响。但随着季节更替，水系消长，不同季节各环境因子影响物种分布的大小有所差异。